Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXD1

HRCT1, Histidine-rich carboxyl terminus protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 115 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HRCT1Q6UXD1 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
HRCT1Q6UXD1 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
HRCT1Q6UXD1 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
HRCT1Q6UXD1 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
HRCT1Q6UXD1 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
HRCT1Q6UXD1 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC11.43□□□□□ -0.58
HRCT1Q6UXD1 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
HRCT1Q6UXD1 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
HRCT1Q6UXD1 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
HRCT1Q6UXD1 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
HRCT1Q6UXD1 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
HRCT1Q6UXD1 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
HRCT1Q6UXD1 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
HRCT1Q6UXD1 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
HRCT1Q6UXD1 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
HRCT1Q6UXD1 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
HRCT1Q6UXD1 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
HRCT1Q6UXD1 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
HRCT1Q6UXD1 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
HRCT1Q6UXD1 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
HRCT1Q6UXD1 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
HRCT1Q6UXD1 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
HRCT1Q6UXD1 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
HRCT1Q6UXD1 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
HRCT1Q6UXD1 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
HRCT1Q6UXD1 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
HRCT1Q6UXD1 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
HRCT1Q6UXD1 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
HRCT1Q6UXD1 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
HRCT1Q6UXD1 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
HRCT1Q6UXD1 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
HRCT1Q6UXD1 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
HRCT1Q6UXD1 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
HRCT1Q6UXD1 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
HRCT1Q6UXD1 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
HRCT1Q6UXD1 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
HRCT1Q6UXD1 CASC2-203ENST00000435944 3270 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
HRCT1Q6UXD1 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
HRCT1Q6UXD1 ARNT2-204ENST00000527771 2458 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
HRCT1Q6UXD1 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
HRCT1Q6UXD1 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
HRCT1Q6UXD1 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
HRCT1Q6UXD1 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
HRCT1Q6UXD1 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
HRCT1Q6UXD1 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
HRCT1Q6UXD1 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
HRCT1Q6UXD1 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
HRCT1Q6UXD1 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
HRCT1Q6UXD1 DHX36-213ENST00000496811 6733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
HRCT1Q6UXD1 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
HRCT1Q6UXD1 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
HRCT1Q6UXD1 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
HRCT1Q6UXD1 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
HRCT1Q6UXD1 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC11.42□□□□□ -0.58
HRCT1Q6UXD1 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
HRCT1Q6UXD1 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
HRCT1Q6UXD1 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
HRCT1Q6UXD1 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
HRCT1Q6UXD1 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
HRCT1Q6UXD1 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
HRCT1Q6UXD1 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
HRCT1Q6UXD1 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
HRCT1Q6UXD1 IPO8-201ENST00000256079 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
HRCT1Q6UXD1 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
HRCT1Q6UXD1 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
HRCT1Q6UXD1 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
HRCT1Q6UXD1 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
HRCT1Q6UXD1 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
HRCT1Q6UXD1 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
HRCT1Q6UXD1 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC11.42□□□□□ -0.58
HRCT1Q6UXD1 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
HRCT1Q6UXD1 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
HRCT1Q6UXD1 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
HRCT1Q6UXD1 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
HRCT1Q6UXD1 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
HRCT1Q6UXD1 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
HRCT1Q6UXD1 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
HRCT1Q6UXD1 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
HRCT1Q6UXD1 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
HRCT1Q6UXD1 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
HRCT1Q6UXD1 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
HRCT1Q6UXD1 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
HRCT1Q6UXD1 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
HRCT1Q6UXD1 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
HRCT1Q6UXD1 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
HRCT1Q6UXD1 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
HRCT1Q6UXD1 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
HRCT1Q6UXD1 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
HRCT1Q6UXD1 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
HRCT1Q6UXD1 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
HRCT1Q6UXD1 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
HRCT1Q6UXD1 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
HRCT1Q6UXD1 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
HRCT1Q6UXD1 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
HRCT1Q6UXD1 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
HRCT1Q6UXD1 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
HRCT1Q6UXD1 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
HRCT1Q6UXD1 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
HRCT1Q6UXD1 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
HRCT1Q6UXD1 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms