Protein–RNA interactions for Protein: Q6SA08

TSSK4, Testis-specific serine/threonine-protein kinase 4, humanhuman

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSSK4Q6SA08 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TSSK4Q6SA08 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TSSK4Q6SA08 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TSSK4Q6SA08 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TSSK4Q6SA08 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TSSK4Q6SA08 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TSSK4Q6SA08 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TSSK4Q6SA08 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
TSSK4Q6SA08 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TSSK4Q6SA08 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TSSK4Q6SA08 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TSSK4Q6SA08 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TSSK4Q6SA08 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TSSK4Q6SA08 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TSSK4Q6SA08 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TSSK4Q6SA08 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TSSK4Q6SA08 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TSSK4Q6SA08 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TSSK4Q6SA08 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TSSK4Q6SA08 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TSSK4Q6SA08 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TSSK4Q6SA08 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TSSK4Q6SA08 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TSSK4Q6SA08 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TSSK4Q6SA08 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TSSK4Q6SA08 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TSSK4Q6SA08 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
TSSK4Q6SA08 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TSSK4Q6SA08 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TSSK4Q6SA08 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
TSSK4Q6SA08 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
TSSK4Q6SA08 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TSSK4Q6SA08 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TSSK4Q6SA08 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TSSK4Q6SA08 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TSSK4Q6SA08 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
TSSK4Q6SA08 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
TSSK4Q6SA08 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TSSK4Q6SA08 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
TSSK4Q6SA08 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TSSK4Q6SA08 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TSSK4Q6SA08 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TSSK4Q6SA08 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TSSK4Q6SA08 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TSSK4Q6SA08 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TSSK4Q6SA08 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TSSK4Q6SA08 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TSSK4Q6SA08 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TSSK4Q6SA08 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TSSK4Q6SA08 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
TSSK4Q6SA08 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TSSK4Q6SA08 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TSSK4Q6SA08 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TSSK4Q6SA08 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TSSK4Q6SA08 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TSSK4Q6SA08 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TSSK4Q6SA08 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TSSK4Q6SA08 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TSSK4Q6SA08 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TSSK4Q6SA08 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TSSK4Q6SA08 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
TSSK4Q6SA08 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TSSK4Q6SA08 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TSSK4Q6SA08 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TSSK4Q6SA08 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TSSK4Q6SA08 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TSSK4Q6SA08 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TSSK4Q6SA08 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TSSK4Q6SA08 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TSSK4Q6SA08 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TSSK4Q6SA08 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
TSSK4Q6SA08 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
TSSK4Q6SA08 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TSSK4Q6SA08 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TSSK4Q6SA08 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TSSK4Q6SA08 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TSSK4Q6SA08 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TSSK4Q6SA08 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TSSK4Q6SA08 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TSSK4Q6SA08 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TSSK4Q6SA08 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TSSK4Q6SA08 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TSSK4Q6SA08 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TSSK4Q6SA08 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TSSK4Q6SA08 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TSSK4Q6SA08 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TSSK4Q6SA08 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TSSK4Q6SA08 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TSSK4Q6SA08 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TSSK4Q6SA08 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TSSK4Q6SA08 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TSSK4Q6SA08 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TSSK4Q6SA08 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TSSK4Q6SA08 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TSSK4Q6SA08 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
TSSK4Q6SA08 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TSSK4Q6SA08 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TSSK4Q6SA08 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TSSK4Q6SA08 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TSSK4Q6SA08 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.8 ms