Protein–RNA interactions for Protein: Q6NSJ5

LRRC8E, Volume-regulated anion channel subunit LRRC8E, humanhuman

Predictions only

Length 796 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC8EQ6NSJ5 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
LRRC8EQ6NSJ5 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
LRRC8EQ6NSJ5 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
LRRC8EQ6NSJ5 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
LRRC8EQ6NSJ5 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
LRRC8EQ6NSJ5 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
LRRC8EQ6NSJ5 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
LRRC8EQ6NSJ5 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
LRRC8EQ6NSJ5 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
LRRC8EQ6NSJ5 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
LRRC8EQ6NSJ5 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
LRRC8EQ6NSJ5 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
LRRC8EQ6NSJ5 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
LRRC8EQ6NSJ5 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
LRRC8EQ6NSJ5 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
LRRC8EQ6NSJ5 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.51
LRRC8EQ6NSJ5 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
LRRC8EQ6NSJ5 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LRRC8EQ6NSJ5 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
LRRC8EQ6NSJ5 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LRRC8EQ6NSJ5 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
LRRC8EQ6NSJ5 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
LRRC8EQ6NSJ5 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
LRRC8EQ6NSJ5 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
LRRC8EQ6NSJ5 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
LRRC8EQ6NSJ5 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LRRC8EQ6NSJ5 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LRRC8EQ6NSJ5 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LRRC8EQ6NSJ5 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LRRC8EQ6NSJ5 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
LRRC8EQ6NSJ5 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
LRRC8EQ6NSJ5 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
LRRC8EQ6NSJ5 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
LRRC8EQ6NSJ5 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
LRRC8EQ6NSJ5 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
LRRC8EQ6NSJ5 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
LRRC8EQ6NSJ5 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
LRRC8EQ6NSJ5 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
LRRC8EQ6NSJ5 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LRRC8EQ6NSJ5 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LRRC8EQ6NSJ5 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
LRRC8EQ6NSJ5 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
LRRC8EQ6NSJ5 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
LRRC8EQ6NSJ5 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
LRRC8EQ6NSJ5 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
LRRC8EQ6NSJ5 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LRRC8EQ6NSJ5 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LRRC8EQ6NSJ5 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LRRC8EQ6NSJ5 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LRRC8EQ6NSJ5 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LRRC8EQ6NSJ5 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LRRC8EQ6NSJ5 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LRRC8EQ6NSJ5 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LRRC8EQ6NSJ5 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LRRC8EQ6NSJ5 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
LRRC8EQ6NSJ5 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
LRRC8EQ6NSJ5 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LRRC8EQ6NSJ5 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
LRRC8EQ6NSJ5 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LRRC8EQ6NSJ5 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LRRC8EQ6NSJ5 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LRRC8EQ6NSJ5 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
LRRC8EQ6NSJ5 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
LRRC8EQ6NSJ5 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
LRRC8EQ6NSJ5 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
LRRC8EQ6NSJ5 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
LRRC8EQ6NSJ5 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
LRRC8EQ6NSJ5 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
LRRC8EQ6NSJ5 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
LRRC8EQ6NSJ5 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
LRRC8EQ6NSJ5 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
LRRC8EQ6NSJ5 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LRRC8EQ6NSJ5 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LRRC8EQ6NSJ5 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LRRC8EQ6NSJ5 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
LRRC8EQ6NSJ5 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LRRC8EQ6NSJ5 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LRRC8EQ6NSJ5 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LRRC8EQ6NSJ5 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LRRC8EQ6NSJ5 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
LRRC8EQ6NSJ5 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LRRC8EQ6NSJ5 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
LRRC8EQ6NSJ5 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
LRRC8EQ6NSJ5 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LRRC8EQ6NSJ5 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
LRRC8EQ6NSJ5 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
LRRC8EQ6NSJ5 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
LRRC8EQ6NSJ5 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LRRC8EQ6NSJ5 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LRRC8EQ6NSJ5 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
LRRC8EQ6NSJ5 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
LRRC8EQ6NSJ5 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LRRC8EQ6NSJ5 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
LRRC8EQ6NSJ5 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
LRRC8EQ6NSJ5 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
LRRC8EQ6NSJ5 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
LRRC8EQ6NSJ5 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LRRC8EQ6NSJ5 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LRRC8EQ6NSJ5 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LRRC8EQ6NSJ5 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.3 ms