Protein–RNA interactions for Protein: Q5VX71

SUSD4, Sushi domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUSD4Q5VX71 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SUSD4Q5VX71 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SUSD4Q5VX71 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SUSD4Q5VX71 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SUSD4Q5VX71 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SUSD4Q5VX71 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SUSD4Q5VX71 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
SUSD4Q5VX71 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SUSD4Q5VX71 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SUSD4Q5VX71 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SUSD4Q5VX71 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SUSD4Q5VX71 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SUSD4Q5VX71 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SUSD4Q5VX71 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SUSD4Q5VX71 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SUSD4Q5VX71 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SUSD4Q5VX71 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SUSD4Q5VX71 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
SUSD4Q5VX71 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
SUSD4Q5VX71 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SUSD4Q5VX71 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SUSD4Q5VX71 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SUSD4Q5VX71 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SUSD4Q5VX71 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SUSD4Q5VX71 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
SUSD4Q5VX71 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SUSD4Q5VX71 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SUSD4Q5VX71 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SUSD4Q5VX71 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SUSD4Q5VX71 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SUSD4Q5VX71 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SUSD4Q5VX71 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SUSD4Q5VX71 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SUSD4Q5VX71 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SUSD4Q5VX71 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SUSD4Q5VX71 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SUSD4Q5VX71 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SUSD4Q5VX71 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SUSD4Q5VX71 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SUSD4Q5VX71 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
SUSD4Q5VX71 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
SUSD4Q5VX71 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SUSD4Q5VX71 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SUSD4Q5VX71 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SUSD4Q5VX71 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SUSD4Q5VX71 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SUSD4Q5VX71 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SUSD4Q5VX71 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SUSD4Q5VX71 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SUSD4Q5VX71 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SUSD4Q5VX71 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SUSD4Q5VX71 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SUSD4Q5VX71 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SUSD4Q5VX71 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SUSD4Q5VX71 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SUSD4Q5VX71 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SUSD4Q5VX71 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SUSD4Q5VX71 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SUSD4Q5VX71 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SUSD4Q5VX71 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SUSD4Q5VX71 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SUSD4Q5VX71 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SUSD4Q5VX71 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SUSD4Q5VX71 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SUSD4Q5VX71 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SUSD4Q5VX71 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SUSD4Q5VX71 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SUSD4Q5VX71 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SUSD4Q5VX71 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SUSD4Q5VX71 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SUSD4Q5VX71 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SUSD4Q5VX71 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SUSD4Q5VX71 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SUSD4Q5VX71 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SUSD4Q5VX71 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SUSD4Q5VX71 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SUSD4Q5VX71 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SUSD4Q5VX71 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SUSD4Q5VX71 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SUSD4Q5VX71 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SUSD4Q5VX71 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SUSD4Q5VX71 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SUSD4Q5VX71 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SUSD4Q5VX71 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SUSD4Q5VX71 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SUSD4Q5VX71 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SUSD4Q5VX71 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SUSD4Q5VX71 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SUSD4Q5VX71 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SUSD4Q5VX71 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SUSD4Q5VX71 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
SUSD4Q5VX71 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SUSD4Q5VX71 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SUSD4Q5VX71 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SUSD4Q5VX71 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SUSD4Q5VX71 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SUSD4Q5VX71 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SUSD4Q5VX71 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SUSD4Q5VX71 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
SUSD4Q5VX71 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.8 ms