Protein–RNA interactions for Protein: Q4LDR2

CTXN3, Cortexin-3, humanhuman

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Length 81 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTXN3Q4LDR2 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CTXN3Q4LDR2 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CTXN3Q4LDR2 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CTXN3Q4LDR2 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CTXN3Q4LDR2 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CTXN3Q4LDR2 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
CTXN3Q4LDR2 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CTXN3Q4LDR2 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CTXN3Q4LDR2 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CTXN3Q4LDR2 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CTXN3Q4LDR2 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
CTXN3Q4LDR2 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CTXN3Q4LDR2 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CTXN3Q4LDR2 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CTXN3Q4LDR2 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CTXN3Q4LDR2 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CTXN3Q4LDR2 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CTXN3Q4LDR2 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CTXN3Q4LDR2 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CTXN3Q4LDR2 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CTXN3Q4LDR2 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CTXN3Q4LDR2 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CTXN3Q4LDR2 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CTXN3Q4LDR2 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CTXN3Q4LDR2 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CTXN3Q4LDR2 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CTXN3Q4LDR2 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CTXN3Q4LDR2 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CTXN3Q4LDR2 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CTXN3Q4LDR2 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
CTXN3Q4LDR2 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
CTXN3Q4LDR2 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
CTXN3Q4LDR2 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CTXN3Q4LDR2 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CTXN3Q4LDR2 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CTXN3Q4LDR2 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CTXN3Q4LDR2 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CTXN3Q4LDR2 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
CTXN3Q4LDR2 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CTXN3Q4LDR2 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CTXN3Q4LDR2 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CTXN3Q4LDR2 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CTXN3Q4LDR2 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CTXN3Q4LDR2 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CTXN3Q4LDR2 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CTXN3Q4LDR2 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CTXN3Q4LDR2 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CTXN3Q4LDR2 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CTXN3Q4LDR2 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CTXN3Q4LDR2 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CTXN3Q4LDR2 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CTXN3Q4LDR2 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CTXN3Q4LDR2 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CTXN3Q4LDR2 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CTXN3Q4LDR2 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CTXN3Q4LDR2 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CTXN3Q4LDR2 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CTXN3Q4LDR2 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CTXN3Q4LDR2 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CTXN3Q4LDR2 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CTXN3Q4LDR2 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CTXN3Q4LDR2 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
CTXN3Q4LDR2 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CTXN3Q4LDR2 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CTXN3Q4LDR2 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CTXN3Q4LDR2 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CTXN3Q4LDR2 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CTXN3Q4LDR2 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CTXN3Q4LDR2 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CTXN3Q4LDR2 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CTXN3Q4LDR2 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CTXN3Q4LDR2 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CTXN3Q4LDR2 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CTXN3Q4LDR2 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
CTXN3Q4LDR2 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CTXN3Q4LDR2 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CTXN3Q4LDR2 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CTXN3Q4LDR2 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CTXN3Q4LDR2 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CTXN3Q4LDR2 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CTXN3Q4LDR2 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CTXN3Q4LDR2 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CTXN3Q4LDR2 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CTXN3Q4LDR2 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
CTXN3Q4LDR2 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CTXN3Q4LDR2 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CTXN3Q4LDR2 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CTXN3Q4LDR2 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
CTXN3Q4LDR2 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
CTXN3Q4LDR2 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CTXN3Q4LDR2 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CTXN3Q4LDR2 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CTXN3Q4LDR2 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
CTXN3Q4LDR2 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
CTXN3Q4LDR2 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CTXN3Q4LDR2 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CTXN3Q4LDR2 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CTXN3Q4LDR2 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CTXN3Q4LDR2 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CTXN3Q4LDR2 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
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