Protein–RNA interactions for Protein: Q2TBA0

KLHL40, Kelch-like protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL40Q2TBA0 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
KLHL40Q2TBA0 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
KLHL40Q2TBA0 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
KLHL40Q2TBA0 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
KLHL40Q2TBA0 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
KLHL40Q2TBA0 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
KLHL40Q2TBA0 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
KLHL40Q2TBA0 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
KLHL40Q2TBA0 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
KLHL40Q2TBA0 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
KLHL40Q2TBA0 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
KLHL40Q2TBA0 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
KLHL40Q2TBA0 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
KLHL40Q2TBA0 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
KLHL40Q2TBA0 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
KLHL40Q2TBA0 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
KLHL40Q2TBA0 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
KLHL40Q2TBA0 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
KLHL40Q2TBA0 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
KLHL40Q2TBA0 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
KLHL40Q2TBA0 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
KLHL40Q2TBA0 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
KLHL40Q2TBA0 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
KLHL40Q2TBA0 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
KLHL40Q2TBA0 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
KLHL40Q2TBA0 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
KLHL40Q2TBA0 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
KLHL40Q2TBA0 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
KLHL40Q2TBA0 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
KLHL40Q2TBA0 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
KLHL40Q2TBA0 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
KLHL40Q2TBA0 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
KLHL40Q2TBA0 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
KLHL40Q2TBA0 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
KLHL40Q2TBA0 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
KLHL40Q2TBA0 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
KLHL40Q2TBA0 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
KLHL40Q2TBA0 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
KLHL40Q2TBA0 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
KLHL40Q2TBA0 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
KLHL40Q2TBA0 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
KLHL40Q2TBA0 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
KLHL40Q2TBA0 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
KLHL40Q2TBA0 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
KLHL40Q2TBA0 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
KLHL40Q2TBA0 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
KLHL40Q2TBA0 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
KLHL40Q2TBA0 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
KLHL40Q2TBA0 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
KLHL40Q2TBA0 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
KLHL40Q2TBA0 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
KLHL40Q2TBA0 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
KLHL40Q2TBA0 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
KLHL40Q2TBA0 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
KLHL40Q2TBA0 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
KLHL40Q2TBA0 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
KLHL40Q2TBA0 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
KLHL40Q2TBA0 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
KLHL40Q2TBA0 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
KLHL40Q2TBA0 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
KLHL40Q2TBA0 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
KLHL40Q2TBA0 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
KLHL40Q2TBA0 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
KLHL40Q2TBA0 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
KLHL40Q2TBA0 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
KLHL40Q2TBA0 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
KLHL40Q2TBA0 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
KLHL40Q2TBA0 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
KLHL40Q2TBA0 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
KLHL40Q2TBA0 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
KLHL40Q2TBA0 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
KLHL40Q2TBA0 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
KLHL40Q2TBA0 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
KLHL40Q2TBA0 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
KLHL40Q2TBA0 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
KLHL40Q2TBA0 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
KLHL40Q2TBA0 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
KLHL40Q2TBA0 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
KLHL40Q2TBA0 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
KLHL40Q2TBA0 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
KLHL40Q2TBA0 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
KLHL40Q2TBA0 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
KLHL40Q2TBA0 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
KLHL40Q2TBA0 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
KLHL40Q2TBA0 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
KLHL40Q2TBA0 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
KLHL40Q2TBA0 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
KLHL40Q2TBA0 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
KLHL40Q2TBA0 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC20.91■□□□□ 0.94
KLHL40Q2TBA0 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
KLHL40Q2TBA0 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
KLHL40Q2TBA0 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
KLHL40Q2TBA0 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
KLHL40Q2TBA0 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
KLHL40Q2TBA0 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
KLHL40Q2TBA0 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
KLHL40Q2TBA0 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC20.91■□□□□ 0.94
KLHL40Q2TBA0 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC20.91■□□□□ 0.94
KLHL40Q2TBA0 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
KLHL40Q2TBA0 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms