Protein–RNA interactions for Protein: Q16533

SNAPC1, snRNA-activating protein complex subunit 1, humanhuman

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Length 368 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAPC1Q16533 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SNAPC1Q16533 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SNAPC1Q16533 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SNAPC1Q16533 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SNAPC1Q16533 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SNAPC1Q16533 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SNAPC1Q16533 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SNAPC1Q16533 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SNAPC1Q16533 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SNAPC1Q16533 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SNAPC1Q16533 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SNAPC1Q16533 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SNAPC1Q16533 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SNAPC1Q16533 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SNAPC1Q16533 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SNAPC1Q16533 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SNAPC1Q16533 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SNAPC1Q16533 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SNAPC1Q16533 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SNAPC1Q16533 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
SNAPC1Q16533 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SNAPC1Q16533 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SNAPC1Q16533 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SNAPC1Q16533 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SNAPC1Q16533 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SNAPC1Q16533 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SNAPC1Q16533 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SNAPC1Q16533 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SNAPC1Q16533 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SNAPC1Q16533 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SNAPC1Q16533 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SNAPC1Q16533 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
SNAPC1Q16533 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SNAPC1Q16533 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
SNAPC1Q16533 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
SNAPC1Q16533 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SNAPC1Q16533 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SNAPC1Q16533 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SNAPC1Q16533 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SNAPC1Q16533 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SNAPC1Q16533 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SNAPC1Q16533 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SNAPC1Q16533 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SNAPC1Q16533 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SNAPC1Q16533 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SNAPC1Q16533 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SNAPC1Q16533 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
SNAPC1Q16533 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SNAPC1Q16533 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SNAPC1Q16533 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SNAPC1Q16533 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SNAPC1Q16533 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SNAPC1Q16533 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SNAPC1Q16533 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SNAPC1Q16533 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SNAPC1Q16533 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SNAPC1Q16533 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SNAPC1Q16533 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SNAPC1Q16533 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SNAPC1Q16533 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SNAPC1Q16533 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SNAPC1Q16533 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
SNAPC1Q16533 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SNAPC1Q16533 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
SNAPC1Q16533 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SNAPC1Q16533 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
SNAPC1Q16533 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SNAPC1Q16533 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SNAPC1Q16533 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SNAPC1Q16533 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SNAPC1Q16533 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SNAPC1Q16533 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SNAPC1Q16533 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SNAPC1Q16533 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
SNAPC1Q16533 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SNAPC1Q16533 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SNAPC1Q16533 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SNAPC1Q16533 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SNAPC1Q16533 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SNAPC1Q16533 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SNAPC1Q16533 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SNAPC1Q16533 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SNAPC1Q16533 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SNAPC1Q16533 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SNAPC1Q16533 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SNAPC1Q16533 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SNAPC1Q16533 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SNAPC1Q16533 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SNAPC1Q16533 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SNAPC1Q16533 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SNAPC1Q16533 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
SNAPC1Q16533 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
SNAPC1Q16533 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
SNAPC1Q16533 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SNAPC1Q16533 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SNAPC1Q16533 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SNAPC1Q16533 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SNAPC1Q16533 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SNAPC1Q16533 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SNAPC1Q16533 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
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