Protein–RNA interactions for Protein: Q15049

MLC1, Membrane protein MLC1, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MLC1Q15049 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
MLC1Q15049 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
MLC1Q15049 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
MLC1Q15049 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
MLC1Q15049 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
MLC1Q15049 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
MLC1Q15049 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
MLC1Q15049 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
MLC1Q15049 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
MLC1Q15049 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
MLC1Q15049 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
MLC1Q15049 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
MLC1Q15049 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
MLC1Q15049 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
MLC1Q15049 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
MLC1Q15049 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
MLC1Q15049 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
MLC1Q15049 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
MLC1Q15049 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
MLC1Q15049 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
MLC1Q15049 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
MLC1Q15049 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
MLC1Q15049 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
MLC1Q15049 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
MLC1Q15049 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
MLC1Q15049 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
MLC1Q15049 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
MLC1Q15049 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
MLC1Q15049 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
MLC1Q15049 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
MLC1Q15049 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
MLC1Q15049 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
MLC1Q15049 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
MLC1Q15049 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
MLC1Q15049 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
MLC1Q15049 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
MLC1Q15049 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
MLC1Q15049 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
MLC1Q15049 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
MLC1Q15049 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
MLC1Q15049 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
MLC1Q15049 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
MLC1Q15049 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
MLC1Q15049 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
MLC1Q15049 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
MLC1Q15049 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
MLC1Q15049 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
MLC1Q15049 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
MLC1Q15049 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
MLC1Q15049 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
MLC1Q15049 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
MLC1Q15049 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
MLC1Q15049 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
MLC1Q15049 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
MLC1Q15049 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
MLC1Q15049 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
MLC1Q15049 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
MLC1Q15049 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
MLC1Q15049 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
MLC1Q15049 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
MLC1Q15049 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
MLC1Q15049 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
MLC1Q15049 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
MLC1Q15049 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
MLC1Q15049 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
MLC1Q15049 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
MLC1Q15049 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
MLC1Q15049 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
MLC1Q15049 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
MLC1Q15049 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
MLC1Q15049 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
MLC1Q15049 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
MLC1Q15049 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
MLC1Q15049 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
MLC1Q15049 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
MLC1Q15049 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
MLC1Q15049 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
MLC1Q15049 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
MLC1Q15049 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
MLC1Q15049 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
MLC1Q15049 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
MLC1Q15049 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
MLC1Q15049 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
MLC1Q15049 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.32
MLC1Q15049 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
MLC1Q15049 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
MLC1Q15049 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
MLC1Q15049 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
MLC1Q15049 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
MLC1Q15049 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
MLC1Q15049 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
MLC1Q15049 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
MLC1Q15049 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
MLC1Q15049 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
MLC1Q15049 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
MLC1Q15049 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
MLC1Q15049 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
MLC1Q15049 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
MLC1Q15049 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
MLC1Q15049 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.7 ms