Protein–RNA interactions for Protein: Q14964

RAB39A, Ras-related protein Rab-39A, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB39AQ14964 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RAB39AQ14964 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
RAB39AQ14964 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
RAB39AQ14964 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
RAB39AQ14964 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
RAB39AQ14964 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
RAB39AQ14964 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RAB39AQ14964 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RAB39AQ14964 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RAB39AQ14964 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RAB39AQ14964 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RAB39AQ14964 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RAB39AQ14964 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RAB39AQ14964 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RAB39AQ14964 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RAB39AQ14964 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RAB39AQ14964 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RAB39AQ14964 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RAB39AQ14964 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RAB39AQ14964 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RAB39AQ14964 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
RAB39AQ14964 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RAB39AQ14964 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RAB39AQ14964 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RAB39AQ14964 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RAB39AQ14964 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RAB39AQ14964 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RAB39AQ14964 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RAB39AQ14964 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
RAB39AQ14964 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RAB39AQ14964 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RAB39AQ14964 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RAB39AQ14964 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RAB39AQ14964 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RAB39AQ14964 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RAB39AQ14964 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RAB39AQ14964 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RAB39AQ14964 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RAB39AQ14964 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RAB39AQ14964 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RAB39AQ14964 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RAB39AQ14964 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
RAB39AQ14964 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RAB39AQ14964 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RAB39AQ14964 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
RAB39AQ14964 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
RAB39AQ14964 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RAB39AQ14964 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RAB39AQ14964 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RAB39AQ14964 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RAB39AQ14964 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
RAB39AQ14964 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RAB39AQ14964 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
RAB39AQ14964 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
RAB39AQ14964 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RAB39AQ14964 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RAB39AQ14964 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
RAB39AQ14964 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RAB39AQ14964 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
RAB39AQ14964 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
RAB39AQ14964 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
RAB39AQ14964 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
RAB39AQ14964 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RAB39AQ14964 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
RAB39AQ14964 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
RAB39AQ14964 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
RAB39AQ14964 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
RAB39AQ14964 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
RAB39AQ14964 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RAB39AQ14964 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RAB39AQ14964 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RAB39AQ14964 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RAB39AQ14964 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RAB39AQ14964 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
RAB39AQ14964 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RAB39AQ14964 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RAB39AQ14964 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RAB39AQ14964 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
RAB39AQ14964 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RAB39AQ14964 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
RAB39AQ14964 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RAB39AQ14964 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RAB39AQ14964 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
RAB39AQ14964 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RAB39AQ14964 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RAB39AQ14964 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RAB39AQ14964 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RAB39AQ14964 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RAB39AQ14964 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RAB39AQ14964 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RAB39AQ14964 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RAB39AQ14964 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RAB39AQ14964 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RAB39AQ14964 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RAB39AQ14964 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
RAB39AQ14964 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
RAB39AQ14964 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RAB39AQ14964 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RAB39AQ14964 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RAB39AQ14964 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms