Protein–RNA interactions for Protein: Q14457

BECN1, Beclin-1, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BECN1Q14457 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
BECN1Q14457 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
BECN1Q14457 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
BECN1Q14457 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
BECN1Q14457 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
BECN1Q14457 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
BECN1Q14457 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
BECN1Q14457 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
BECN1Q14457 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
BECN1Q14457 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
BECN1Q14457 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
BECN1Q14457 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
BECN1Q14457 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
BECN1Q14457 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
BECN1Q14457 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
BECN1Q14457 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
BECN1Q14457 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
BECN1Q14457 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
BECN1Q14457 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
BECN1Q14457 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
BECN1Q14457 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
BECN1Q14457 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
BECN1Q14457 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
BECN1Q14457 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
BECN1Q14457 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
BECN1Q14457 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
BECN1Q14457 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
BECN1Q14457 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
BECN1Q14457 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
BECN1Q14457 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
BECN1Q14457 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
BECN1Q14457 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
BECN1Q14457 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
BECN1Q14457 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
BECN1Q14457 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
BECN1Q14457 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
BECN1Q14457 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
BECN1Q14457 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
BECN1Q14457 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
BECN1Q14457 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
BECN1Q14457 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
BECN1Q14457 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
BECN1Q14457 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
BECN1Q14457 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
BECN1Q14457 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
BECN1Q14457 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
BECN1Q14457 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
BECN1Q14457 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
BECN1Q14457 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
BECN1Q14457 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
BECN1Q14457 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
BECN1Q14457 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
BECN1Q14457 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
BECN1Q14457 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
BECN1Q14457 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
BECN1Q14457 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
BECN1Q14457 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
BECN1Q14457 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
BECN1Q14457 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
BECN1Q14457 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
BECN1Q14457 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
BECN1Q14457 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
BECN1Q14457 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
BECN1Q14457 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
BECN1Q14457 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
BECN1Q14457 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
BECN1Q14457 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
BECN1Q14457 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
BECN1Q14457 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
BECN1Q14457 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
BECN1Q14457 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
BECN1Q14457 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
BECN1Q14457 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
BECN1Q14457 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
BECN1Q14457 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
BECN1Q14457 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
BECN1Q14457 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
BECN1Q14457 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
BECN1Q14457 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
BECN1Q14457 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
BECN1Q14457 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
BECN1Q14457 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
BECN1Q14457 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
BECN1Q14457 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
BECN1Q14457 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
BECN1Q14457 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
BECN1Q14457 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
BECN1Q14457 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
BECN1Q14457 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
BECN1Q14457 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
BECN1Q14457 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
BECN1Q14457 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC22.02■■□□□ 1.11
BECN1Q14457 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
BECN1Q14457 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC22.02■■□□□ 1.11
BECN1Q14457 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
BECN1Q14457 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
BECN1Q14457 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
BECN1Q14457 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
BECN1Q14457 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
BECN1Q14457 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
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