Protein–RNA interactions for Protein: Q13956

PDE6H, Retinal cone rhodopsin-sensitive cGMP 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit gamma, humanhuman

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Length 83 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE6HQ13956 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
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PDE6HQ13956 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PDE6HQ13956 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
PDE6HQ13956 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PDE6HQ13956 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
PDE6HQ13956 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
PDE6HQ13956 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
PDE6HQ13956 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
PDE6HQ13956 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
PDE6HQ13956 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
PDE6HQ13956 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
PDE6HQ13956 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PDE6HQ13956 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
PDE6HQ13956 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PDE6HQ13956 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
PDE6HQ13956 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
PDE6HQ13956 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
PDE6HQ13956 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PDE6HQ13956 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PDE6HQ13956 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PDE6HQ13956 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
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PDE6HQ13956 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
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PDE6HQ13956 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.88□□□□□ -0.19
PDE6HQ13956 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PDE6HQ13956 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PDE6HQ13956 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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PDE6HQ13956 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
PDE6HQ13956 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
PDE6HQ13956 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PDE6HQ13956 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PDE6HQ13956 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PDE6HQ13956 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PDE6HQ13956 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
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