Protein–RNA interactions for Protein: Q13790

APOF, Apolipoprotein F, humanhuman

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Length 326 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOFQ13790 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
APOFQ13790 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
APOFQ13790 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
APOFQ13790 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
APOFQ13790 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
APOFQ13790 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
APOFQ13790 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
APOFQ13790 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
APOFQ13790 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
APOFQ13790 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
APOFQ13790 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
APOFQ13790 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
APOFQ13790 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
APOFQ13790 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
APOFQ13790 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
APOFQ13790 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
APOFQ13790 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
APOFQ13790 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
APOFQ13790 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
APOFQ13790 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
APOFQ13790 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
APOFQ13790 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
APOFQ13790 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
APOFQ13790 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
APOFQ13790 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
APOFQ13790 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
APOFQ13790 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
APOFQ13790 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
APOFQ13790 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
APOFQ13790 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
APOFQ13790 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
APOFQ13790 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
APOFQ13790 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
APOFQ13790 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
APOFQ13790 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
APOFQ13790 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
APOFQ13790 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
APOFQ13790 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
APOFQ13790 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
APOFQ13790 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
APOFQ13790 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
APOFQ13790 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
APOFQ13790 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
APOFQ13790 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
APOFQ13790 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
APOFQ13790 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
APOFQ13790 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
APOFQ13790 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
APOFQ13790 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
APOFQ13790 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
APOFQ13790 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
APOFQ13790 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
APOFQ13790 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
APOFQ13790 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
APOFQ13790 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC16.96■□□□□ 0.31
APOFQ13790 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
APOFQ13790 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
APOFQ13790 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
APOFQ13790 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
APOFQ13790 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
APOFQ13790 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
APOFQ13790 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
APOFQ13790 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
APOFQ13790 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
APOFQ13790 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
APOFQ13790 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
APOFQ13790 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
APOFQ13790 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.3
APOFQ13790 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
APOFQ13790 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
APOFQ13790 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
APOFQ13790 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
APOFQ13790 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
APOFQ13790 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
APOFQ13790 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
APOFQ13790 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
APOFQ13790 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
APOFQ13790 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
APOFQ13790 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
APOFQ13790 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
APOFQ13790 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
APOFQ13790 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
APOFQ13790 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
APOFQ13790 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
APOFQ13790 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
APOFQ13790 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
APOFQ13790 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
APOFQ13790 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
APOFQ13790 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
APOFQ13790 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
APOFQ13790 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
APOFQ13790 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
APOFQ13790 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
APOFQ13790 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
APOFQ13790 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
APOFQ13790 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
APOFQ13790 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
APOFQ13790 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
APOFQ13790 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
APOFQ13790 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
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