Protein–RNA interactions for Protein: Q13683

ITGA7, Integrin alpha-7, humanhuman

Predictions only

Length 1,181 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA7Q13683 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ITGA7Q13683 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ITGA7Q13683 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ITGA7Q13683 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ITGA7Q13683 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ITGA7Q13683 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ITGA7Q13683 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ITGA7Q13683 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ITGA7Q13683 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ITGA7Q13683 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ITGA7Q13683 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ITGA7Q13683 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ITGA7Q13683 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ITGA7Q13683 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ITGA7Q13683 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ITGA7Q13683 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ITGA7Q13683 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ITGA7Q13683 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ITGA7Q13683 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ITGA7Q13683 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ITGA7Q13683 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ITGA7Q13683 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ITGA7Q13683 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ITGA7Q13683 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ITGA7Q13683 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ITGA7Q13683 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
ITGA7Q13683 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ITGA7Q13683 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
ITGA7Q13683 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ITGA7Q13683 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
ITGA7Q13683 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ITGA7Q13683 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ITGA7Q13683 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
ITGA7Q13683 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ITGA7Q13683 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ITGA7Q13683 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ITGA7Q13683 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ITGA7Q13683 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ITGA7Q13683 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
ITGA7Q13683 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ITGA7Q13683 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ITGA7Q13683 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ITGA7Q13683 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ITGA7Q13683 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ITGA7Q13683 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ITGA7Q13683 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ITGA7Q13683 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ITGA7Q13683 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ITGA7Q13683 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
ITGA7Q13683 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ITGA7Q13683 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ITGA7Q13683 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ITGA7Q13683 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ITGA7Q13683 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ITGA7Q13683 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ITGA7Q13683 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
ITGA7Q13683 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ITGA7Q13683 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ITGA7Q13683 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ITGA7Q13683 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
ITGA7Q13683 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ITGA7Q13683 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ITGA7Q13683 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ITGA7Q13683 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
ITGA7Q13683 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ITGA7Q13683 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ITGA7Q13683 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ITGA7Q13683 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
ITGA7Q13683 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ITGA7Q13683 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ITGA7Q13683 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ITGA7Q13683 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ITGA7Q13683 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ITGA7Q13683 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ITGA7Q13683 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ITGA7Q13683 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ITGA7Q13683 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ITGA7Q13683 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ITGA7Q13683 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
ITGA7Q13683 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ITGA7Q13683 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ITGA7Q13683 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ITGA7Q13683 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ITGA7Q13683 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
ITGA7Q13683 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ITGA7Q13683 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ITGA7Q13683 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ITGA7Q13683 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ITGA7Q13683 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ITGA7Q13683 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ITGA7Q13683 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ITGA7Q13683 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ITGA7Q13683 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ITGA7Q13683 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ITGA7Q13683 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ITGA7Q13683 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ITGA7Q13683 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ITGA7Q13683 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ITGA7Q13683 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ITGA7Q13683 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms