Protein–RNA interactions for Protein: Q12824

SMARCB1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily B member 1, humanhuman

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Length 385 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCB1Q12824 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SMARCB1Q12824 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SMARCB1Q12824 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SMARCB1Q12824 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SMARCB1Q12824 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SMARCB1Q12824 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SMARCB1Q12824 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SMARCB1Q12824 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
SMARCB1Q12824 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SMARCB1Q12824 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SMARCB1Q12824 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SMARCB1Q12824 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SMARCB1Q12824 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
SMARCB1Q12824 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
SMARCB1Q12824 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SMARCB1Q12824 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SMARCB1Q12824 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SMARCB1Q12824 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SMARCB1Q12824 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SMARCB1Q12824 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SMARCB1Q12824 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SMARCB1Q12824 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SMARCB1Q12824 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SMARCB1Q12824 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
SMARCB1Q12824 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SMARCB1Q12824 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SMARCB1Q12824 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SMARCB1Q12824 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SMARCB1Q12824 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SMARCB1Q12824 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SMARCB1Q12824 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SMARCB1Q12824 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SMARCB1Q12824 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SMARCB1Q12824 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SMARCB1Q12824 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SMARCB1Q12824 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SMARCB1Q12824 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SMARCB1Q12824 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SMARCB1Q12824 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SMARCB1Q12824 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SMARCB1Q12824 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SMARCB1Q12824 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SMARCB1Q12824 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SMARCB1Q12824 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
SMARCB1Q12824 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SMARCB1Q12824 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SMARCB1Q12824 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SMARCB1Q12824 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SMARCB1Q12824 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SMARCB1Q12824 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SMARCB1Q12824 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
SMARCB1Q12824 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SMARCB1Q12824 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SMARCB1Q12824 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
SMARCB1Q12824 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SMARCB1Q12824 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SMARCB1Q12824 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SMARCB1Q12824 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SMARCB1Q12824 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SMARCB1Q12824 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SMARCB1Q12824 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SMARCB1Q12824 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SMARCB1Q12824 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SMARCB1Q12824 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SMARCB1Q12824 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SMARCB1Q12824 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SMARCB1Q12824 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
SMARCB1Q12824 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SMARCB1Q12824 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SMARCB1Q12824 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SMARCB1Q12824 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SMARCB1Q12824 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SMARCB1Q12824 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SMARCB1Q12824 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SMARCB1Q12824 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SMARCB1Q12824 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SMARCB1Q12824 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
SMARCB1Q12824 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SMARCB1Q12824 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SMARCB1Q12824 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SMARCB1Q12824 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SMARCB1Q12824 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
SMARCB1Q12824 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SMARCB1Q12824 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
SMARCB1Q12824 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
SMARCB1Q12824 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SMARCB1Q12824 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SMARCB1Q12824 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SMARCB1Q12824 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SMARCB1Q12824 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SMARCB1Q12824 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SMARCB1Q12824 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
SMARCB1Q12824 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SMARCB1Q12824 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SMARCB1Q12824 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SMARCB1Q12824 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SMARCB1Q12824 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SMARCB1Q12824 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SMARCB1Q12824 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SMARCB1Q12824 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
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