Protein–RNA interactions for Protein: Q08AH1

ACSM1, Acyl-coenzyme A synthetase ACSM1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 577 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACSM1Q08AH1 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ACSM1Q08AH1 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ACSM1Q08AH1 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ACSM1Q08AH1 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ACSM1Q08AH1 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ACSM1Q08AH1 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ACSM1Q08AH1 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ACSM1Q08AH1 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ACSM1Q08AH1 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ACSM1Q08AH1 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ACSM1Q08AH1 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ACSM1Q08AH1 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ACSM1Q08AH1 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ACSM1Q08AH1 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ACSM1Q08AH1 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ACSM1Q08AH1 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ACSM1Q08AH1 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ACSM1Q08AH1 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
ACSM1Q08AH1 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ACSM1Q08AH1 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
ACSM1Q08AH1 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ACSM1Q08AH1 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ACSM1Q08AH1 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
ACSM1Q08AH1 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ACSM1Q08AH1 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ACSM1Q08AH1 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
ACSM1Q08AH1 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
ACSM1Q08AH1 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ACSM1Q08AH1 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
ACSM1Q08AH1 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ACSM1Q08AH1 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ACSM1Q08AH1 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ACSM1Q08AH1 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ACSM1Q08AH1 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ACSM1Q08AH1 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ACSM1Q08AH1 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ACSM1Q08AH1 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ACSM1Q08AH1 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ACSM1Q08AH1 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ACSM1Q08AH1 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ACSM1Q08AH1 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ACSM1Q08AH1 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ACSM1Q08AH1 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ACSM1Q08AH1 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ACSM1Q08AH1 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ACSM1Q08AH1 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ACSM1Q08AH1 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ACSM1Q08AH1 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ACSM1Q08AH1 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ACSM1Q08AH1 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ACSM1Q08AH1 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ACSM1Q08AH1 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ACSM1Q08AH1 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ACSM1Q08AH1 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ACSM1Q08AH1 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ACSM1Q08AH1 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ACSM1Q08AH1 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ACSM1Q08AH1 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
ACSM1Q08AH1 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ACSM1Q08AH1 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ACSM1Q08AH1 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ACSM1Q08AH1 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
ACSM1Q08AH1 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ACSM1Q08AH1 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ACSM1Q08AH1 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ACSM1Q08AH1 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ACSM1Q08AH1 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ACSM1Q08AH1 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ACSM1Q08AH1 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ACSM1Q08AH1 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
ACSM1Q08AH1 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
ACSM1Q08AH1 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
ACSM1Q08AH1 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ACSM1Q08AH1 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ACSM1Q08AH1 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ACSM1Q08AH1 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ACSM1Q08AH1 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ACSM1Q08AH1 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ACSM1Q08AH1 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
ACSM1Q08AH1 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ACSM1Q08AH1 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ACSM1Q08AH1 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ACSM1Q08AH1 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ACSM1Q08AH1 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ACSM1Q08AH1 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ACSM1Q08AH1 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ACSM1Q08AH1 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ACSM1Q08AH1 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ACSM1Q08AH1 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ACSM1Q08AH1 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
ACSM1Q08AH1 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ACSM1Q08AH1 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ACSM1Q08AH1 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ACSM1Q08AH1 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ACSM1Q08AH1 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ACSM1Q08AH1 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ACSM1Q08AH1 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ACSM1Q08AH1 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ACSM1Q08AH1 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ACSM1Q08AH1 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms