Protein–RNA interactions for Protein: Q08170

SRSF4, Serine/arginine-rich splicing factor 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF4Q08170 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SRSF4Q08170 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SRSF4Q08170 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SRSF4Q08170 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SRSF4Q08170 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SRSF4Q08170 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SRSF4Q08170 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SRSF4Q08170 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SRSF4Q08170 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SRSF4Q08170 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SRSF4Q08170 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SRSF4Q08170 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SRSF4Q08170 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SRSF4Q08170 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SRSF4Q08170 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SRSF4Q08170 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SRSF4Q08170 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SRSF4Q08170 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SRSF4Q08170 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SRSF4Q08170 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SRSF4Q08170 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SRSF4Q08170 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SRSF4Q08170 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SRSF4Q08170 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SRSF4Q08170 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SRSF4Q08170 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SRSF4Q08170 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SRSF4Q08170 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SRSF4Q08170 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SRSF4Q08170 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SRSF4Q08170 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SRSF4Q08170 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SRSF4Q08170 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SRSF4Q08170 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SRSF4Q08170 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SRSF4Q08170 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SRSF4Q08170 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SRSF4Q08170 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SRSF4Q08170 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SRSF4Q08170 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SRSF4Q08170 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SRSF4Q08170 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SRSF4Q08170 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SRSF4Q08170 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SRSF4Q08170 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SRSF4Q08170 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SRSF4Q08170 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SRSF4Q08170 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SRSF4Q08170 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SRSF4Q08170 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SRSF4Q08170 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SRSF4Q08170 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SRSF4Q08170 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SRSF4Q08170 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SRSF4Q08170 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SRSF4Q08170 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SRSF4Q08170 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SRSF4Q08170 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SRSF4Q08170 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SRSF4Q08170 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SRSF4Q08170 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SRSF4Q08170 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SRSF4Q08170 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
SRSF4Q08170 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SRSF4Q08170 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
SRSF4Q08170 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SRSF4Q08170 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
SRSF4Q08170 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SRSF4Q08170 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SRSF4Q08170 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SRSF4Q08170 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SRSF4Q08170 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SRSF4Q08170 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SRSF4Q08170 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SRSF4Q08170 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SRSF4Q08170 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SRSF4Q08170 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SRSF4Q08170 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SRSF4Q08170 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SRSF4Q08170 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SRSF4Q08170 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SRSF4Q08170 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SRSF4Q08170 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SRSF4Q08170 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SRSF4Q08170 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SRSF4Q08170 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SRSF4Q08170 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SRSF4Q08170 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SRSF4Q08170 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SRSF4Q08170 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SRSF4Q08170 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SRSF4Q08170 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SRSF4Q08170 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SRSF4Q08170 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SRSF4Q08170 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SRSF4Q08170 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SRSF4Q08170 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SRSF4Q08170 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SRSF4Q08170 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SRSF4Q08170 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.3 ms