Protein–RNA interactions for Protein: Q06124

PTPN11, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 11, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 597 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN11Q06124 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PTPN11Q06124 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PTPN11Q06124 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PTPN11Q06124 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PTPN11Q06124 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PTPN11Q06124 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PTPN11Q06124 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PTPN11Q06124 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PTPN11Q06124 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PTPN11Q06124 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PTPN11Q06124 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PTPN11Q06124 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PTPN11Q06124 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PTPN11Q06124 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PTPN11Q06124 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PTPN11Q06124 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PTPN11Q06124 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PTPN11Q06124 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PTPN11Q06124 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PTPN11Q06124 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
PTPN11Q06124 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PTPN11Q06124 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
PTPN11Q06124 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PTPN11Q06124 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PTPN11Q06124 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
PTPN11Q06124 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
PTPN11Q06124 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
PTPN11Q06124 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PTPN11Q06124 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PTPN11Q06124 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PTPN11Q06124 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
PTPN11Q06124 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PTPN11Q06124 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
PTPN11Q06124 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PTPN11Q06124 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PTPN11Q06124 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
PTPN11Q06124 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
PTPN11Q06124 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.82
PTPN11Q06124 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
PTPN11Q06124 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PTPN11Q06124 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PTPN11Q06124 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PTPN11Q06124 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
PTPN11Q06124 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PTPN11Q06124 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PTPN11Q06124 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PTPN11Q06124 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PTPN11Q06124 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PTPN11Q06124 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PTPN11Q06124 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PTPN11Q06124 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PTPN11Q06124 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PTPN11Q06124 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
PTPN11Q06124 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
PTPN11Q06124 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
PTPN11Q06124 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
PTPN11Q06124 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PTPN11Q06124 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
PTPN11Q06124 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PTPN11Q06124 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PTPN11Q06124 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PTPN11Q06124 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PTPN11Q06124 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PTPN11Q06124 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PTPN11Q06124 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PTPN11Q06124 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PTPN11Q06124 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PTPN11Q06124 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PTPN11Q06124 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PTPN11Q06124 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PTPN11Q06124 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PTPN11Q06124 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PTPN11Q06124 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PTPN11Q06124 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PTPN11Q06124 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PTPN11Q06124 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PTPN11Q06124 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PTPN11Q06124 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PTPN11Q06124 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PTPN11Q06124 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PTPN11Q06124 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PTPN11Q06124 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PTPN11Q06124 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PTPN11Q06124 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PTPN11Q06124 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PTPN11Q06124 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PTPN11Q06124 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PTPN11Q06124 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PTPN11Q06124 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PTPN11Q06124 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PTPN11Q06124 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PTPN11Q06124 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PTPN11Q06124 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PTPN11Q06124 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PTPN11Q06124 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PTPN11Q06124 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PTPN11Q06124 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PTPN11Q06124 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PTPN11Q06124 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PTPN11Q06124 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.4 ms