Protein–RNA interactions for Protein: P78552

IL13RA1, Interleukin-13 receptor subunit alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 427 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IL13RA1P78552 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
IL13RA1P78552 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
IL13RA1P78552 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
IL13RA1P78552 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
IL13RA1P78552 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
IL13RA1P78552 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
IL13RA1P78552 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
IL13RA1P78552 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
IL13RA1P78552 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
IL13RA1P78552 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
IL13RA1P78552 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
IL13RA1P78552 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
IL13RA1P78552 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
IL13RA1P78552 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
IL13RA1P78552 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
IL13RA1P78552 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
IL13RA1P78552 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
IL13RA1P78552 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
IL13RA1P78552 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
IL13RA1P78552 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
IL13RA1P78552 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
IL13RA1P78552 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
IL13RA1P78552 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
IL13RA1P78552 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
IL13RA1P78552 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
IL13RA1P78552 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
IL13RA1P78552 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
IL13RA1P78552 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
IL13RA1P78552 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
IL13RA1P78552 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
IL13RA1P78552 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
IL13RA1P78552 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
IL13RA1P78552 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
IL13RA1P78552 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
IL13RA1P78552 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
IL13RA1P78552 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
IL13RA1P78552 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
IL13RA1P78552 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
IL13RA1P78552 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
IL13RA1P78552 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
IL13RA1P78552 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
IL13RA1P78552 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
IL13RA1P78552 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
IL13RA1P78552 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
IL13RA1P78552 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
IL13RA1P78552 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
IL13RA1P78552 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
IL13RA1P78552 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
IL13RA1P78552 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
IL13RA1P78552 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
IL13RA1P78552 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
IL13RA1P78552 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
IL13RA1P78552 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
IL13RA1P78552 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
IL13RA1P78552 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
IL13RA1P78552 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
IL13RA1P78552 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
IL13RA1P78552 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
IL13RA1P78552 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
IL13RA1P78552 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
IL13RA1P78552 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
IL13RA1P78552 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
IL13RA1P78552 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
IL13RA1P78552 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
IL13RA1P78552 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
IL13RA1P78552 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
IL13RA1P78552 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
IL13RA1P78552 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
IL13RA1P78552 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
IL13RA1P78552 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
IL13RA1P78552 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
IL13RA1P78552 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
IL13RA1P78552 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
IL13RA1P78552 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
IL13RA1P78552 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
IL13RA1P78552 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
IL13RA1P78552 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
IL13RA1P78552 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
IL13RA1P78552 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
IL13RA1P78552 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
IL13RA1P78552 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
IL13RA1P78552 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
IL13RA1P78552 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
IL13RA1P78552 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
IL13RA1P78552 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
IL13RA1P78552 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
IL13RA1P78552 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
IL13RA1P78552 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
IL13RA1P78552 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
IL13RA1P78552 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
IL13RA1P78552 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
IL13RA1P78552 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
IL13RA1P78552 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
IL13RA1P78552 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
IL13RA1P78552 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
IL13RA1P78552 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
IL13RA1P78552 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
IL13RA1P78552 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
IL13RA1P78552 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
IL13RA1P78552 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms