Protein–RNA interactions for Protein: P78426

NKX6-1, Homeobox protein Nkx-6.1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKX6-1P78426 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NKX6-1P78426 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NKX6-1P78426 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NKX6-1P78426 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
NKX6-1P78426 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NKX6-1P78426 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NKX6-1P78426 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NKX6-1P78426 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NKX6-1P78426 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NKX6-1P78426 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NKX6-1P78426 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NKX6-1P78426 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
NKX6-1P78426 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
NKX6-1P78426 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
NKX6-1P78426 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
NKX6-1P78426 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.17
NKX6-1P78426 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
NKX6-1P78426 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
NKX6-1P78426 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
NKX6-1P78426 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
NKX6-1P78426 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
NKX6-1P78426 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
NKX6-1P78426 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NKX6-1P78426 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NKX6-1P78426 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NKX6-1P78426 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NKX6-1P78426 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NKX6-1P78426 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NKX6-1P78426 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NKX6-1P78426 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NKX6-1P78426 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NKX6-1P78426 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NKX6-1P78426 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NKX6-1P78426 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
NKX6-1P78426 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
NKX6-1P78426 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NKX6-1P78426 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NKX6-1P78426 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NKX6-1P78426 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NKX6-1P78426 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NKX6-1P78426 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
NKX6-1P78426 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NKX6-1P78426 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
NKX6-1P78426 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NKX6-1P78426 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NKX6-1P78426 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NKX6-1P78426 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NKX6-1P78426 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NKX6-1P78426 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
NKX6-1P78426 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NKX6-1P78426 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NKX6-1P78426 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NKX6-1P78426 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NKX6-1P78426 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NKX6-1P78426 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NKX6-1P78426 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NKX6-1P78426 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NKX6-1P78426 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NKX6-1P78426 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NKX6-1P78426 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NKX6-1P78426 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NKX6-1P78426 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NKX6-1P78426 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NKX6-1P78426 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NKX6-1P78426 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NKX6-1P78426 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NKX6-1P78426 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NKX6-1P78426 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NKX6-1P78426 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NKX6-1P78426 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NKX6-1P78426 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NKX6-1P78426 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NKX6-1P78426 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NKX6-1P78426 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NKX6-1P78426 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NKX6-1P78426 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NKX6-1P78426 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NKX6-1P78426 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NKX6-1P78426 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NKX6-1P78426 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NKX6-1P78426 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NKX6-1P78426 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NKX6-1P78426 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NKX6-1P78426 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NKX6-1P78426 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NKX6-1P78426 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NKX6-1P78426 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NKX6-1P78426 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NKX6-1P78426 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NKX6-1P78426 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NKX6-1P78426 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NKX6-1P78426 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NKX6-1P78426 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NKX6-1P78426 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NKX6-1P78426 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NKX6-1P78426 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NKX6-1P78426 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NKX6-1P78426 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NKX6-1P78426 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NKX6-1P78426 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.5 ms