Protein–RNA interactions for Protein: P55196

AFDN, Afadin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,824 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AFDNP55196 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
AFDNP55196 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
AFDNP55196 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
AFDNP55196 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
AFDNP55196 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
AFDNP55196 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
AFDNP55196 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
AFDNP55196 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
AFDNP55196 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
AFDNP55196 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
AFDNP55196 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
AFDNP55196 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
AFDNP55196 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
AFDNP55196 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
AFDNP55196 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
AFDNP55196 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
AFDNP55196 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
AFDNP55196 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
AFDNP55196 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
AFDNP55196 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
AFDNP55196 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
AFDNP55196 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
AFDNP55196 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
AFDNP55196 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
AFDNP55196 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
AFDNP55196 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
AFDNP55196 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
AFDNP55196 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
AFDNP55196 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
AFDNP55196 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
AFDNP55196 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
AFDNP55196 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
AFDNP55196 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
AFDNP55196 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
AFDNP55196 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
AFDNP55196 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
AFDNP55196 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
AFDNP55196 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
AFDNP55196 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
AFDNP55196 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
AFDNP55196 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
AFDNP55196 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
AFDNP55196 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
AFDNP55196 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
AFDNP55196 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.26
AFDNP55196 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
AFDNP55196 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
AFDNP55196 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
AFDNP55196 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
AFDNP55196 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
AFDNP55196 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
AFDNP55196 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
AFDNP55196 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
AFDNP55196 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
AFDNP55196 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
AFDNP55196 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
AFDNP55196 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
AFDNP55196 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
AFDNP55196 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
AFDNP55196 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
AFDNP55196 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
AFDNP55196 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
AFDNP55196 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
AFDNP55196 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
AFDNP55196 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
AFDNP55196 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
AFDNP55196 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
AFDNP55196 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
AFDNP55196 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
AFDNP55196 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
AFDNP55196 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
AFDNP55196 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
AFDNP55196 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
AFDNP55196 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
AFDNP55196 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
AFDNP55196 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
AFDNP55196 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
AFDNP55196 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
AFDNP55196 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
AFDNP55196 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
AFDNP55196 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
AFDNP55196 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
AFDNP55196 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
AFDNP55196 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
AFDNP55196 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
AFDNP55196 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
AFDNP55196 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
AFDNP55196 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
AFDNP55196 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
AFDNP55196 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
AFDNP55196 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
AFDNP55196 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
AFDNP55196 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
AFDNP55196 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
AFDNP55196 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
AFDNP55196 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
AFDNP55196 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
AFDNP55196 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
AFDNP55196 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
AFDNP55196 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.3 ms