Protein–RNA interactions for Protein: P49639

HOXA1, Homeobox protein Hox-A1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 335 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA1P49639 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HOXA1P49639 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HOXA1P49639 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HOXA1P49639 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HOXA1P49639 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HOXA1P49639 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HOXA1P49639 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HOXA1P49639 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HOXA1P49639 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HOXA1P49639 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HOXA1P49639 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HOXA1P49639 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HOXA1P49639 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HOXA1P49639 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HOXA1P49639 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HOXA1P49639 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HOXA1P49639 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HOXA1P49639 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HOXA1P49639 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HOXA1P49639 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HOXA1P49639 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HOXA1P49639 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HOXA1P49639 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HOXA1P49639 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HOXA1P49639 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HOXA1P49639 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HOXA1P49639 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HOXA1P49639 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HOXA1P49639 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HOXA1P49639 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HOXA1P49639 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HOXA1P49639 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HOXA1P49639 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HOXA1P49639 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HOXA1P49639 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HOXA1P49639 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HOXA1P49639 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HOXA1P49639 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HOXA1P49639 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HOXA1P49639 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HOXA1P49639 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
HOXA1P49639 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HOXA1P49639 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HOXA1P49639 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HOXA1P49639 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HOXA1P49639 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HOXA1P49639 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HOXA1P49639 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HOXA1P49639 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HOXA1P49639 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
HOXA1P49639 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HOXA1P49639 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
HOXA1P49639 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
HOXA1P49639 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HOXA1P49639 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
HOXA1P49639 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HOXA1P49639 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HOXA1P49639 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HOXA1P49639 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HOXA1P49639 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HOXA1P49639 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HOXA1P49639 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HOXA1P49639 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HOXA1P49639 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HOXA1P49639 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HOXA1P49639 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HOXA1P49639 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HOXA1P49639 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
HOXA1P49639 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HOXA1P49639 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HOXA1P49639 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HOXA1P49639 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HOXA1P49639 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HOXA1P49639 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HOXA1P49639 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
HOXA1P49639 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HOXA1P49639 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HOXA1P49639 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HOXA1P49639 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HOXA1P49639 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HOXA1P49639 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HOXA1P49639 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HOXA1P49639 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HOXA1P49639 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HOXA1P49639 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HOXA1P49639 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HOXA1P49639 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HOXA1P49639 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HOXA1P49639 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HOXA1P49639 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HOXA1P49639 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HOXA1P49639 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HOXA1P49639 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HOXA1P49639 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HOXA1P49639 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HOXA1P49639 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
HOXA1P49639 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HOXA1P49639 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HOXA1P49639 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
HOXA1P49639 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms