Protein–RNA interactions for Protein: P42166

TMPO, Lamina-associated polypeptide 2, isoform alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 694 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMPOP42166 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
TMPOP42166 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TMPOP42166 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TMPOP42166 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TMPOP42166 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TMPOP42166 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TMPOP42166 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TMPOP42166 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TMPOP42166 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TMPOP42166 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TMPOP42166 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TMPOP42166 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TMPOP42166 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TMPOP42166 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TMPOP42166 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TMPOP42166 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TMPOP42166 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TMPOP42166 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TMPOP42166 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TMPOP42166 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TMPOP42166 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TMPOP42166 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TMPOP42166 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
TMPOP42166 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
TMPOP42166 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TMPOP42166 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TMPOP42166 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TMPOP42166 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TMPOP42166 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TMPOP42166 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TMPOP42166 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TMPOP42166 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TMPOP42166 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TMPOP42166 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TMPOP42166 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TMPOP42166 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TMPOP42166 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TMPOP42166 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TMPOP42166 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TMPOP42166 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TMPOP42166 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TMPOP42166 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
TMPOP42166 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TMPOP42166 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TMPOP42166 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
TMPOP42166 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TMPOP42166 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
TMPOP42166 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TMPOP42166 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
TMPOP42166 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TMPOP42166 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TMPOP42166 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TMPOP42166 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
TMPOP42166 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TMPOP42166 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TMPOP42166 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TMPOP42166 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TMPOP42166 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TMPOP42166 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TMPOP42166 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TMPOP42166 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TMPOP42166 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TMPOP42166 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TMPOP42166 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TMPOP42166 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TMPOP42166 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TMPOP42166 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TMPOP42166 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TMPOP42166 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TMPOP42166 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TMPOP42166 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
TMPOP42166 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TMPOP42166 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TMPOP42166 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TMPOP42166 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TMPOP42166 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TMPOP42166 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TMPOP42166 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TMPOP42166 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TMPOP42166 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TMPOP42166 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TMPOP42166 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TMPOP42166 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TMPOP42166 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
TMPOP42166 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
TMPOP42166 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TMPOP42166 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TMPOP42166 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TMPOP42166 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TMPOP42166 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
TMPOP42166 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
TMPOP42166 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TMPOP42166 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TMPOP42166 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TMPOP42166 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TMPOP42166 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TMPOP42166 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TMPOP42166 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TMPOP42166 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TMPOP42166 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.8 ms