Protein–RNA interactions for Protein: P38570

ITGAE, Integrin alpha-E, humanhuman

Predictions only

Length 1,179 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGAEP38570 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
ITGAEP38570 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
ITGAEP38570 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
ITGAEP38570 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
ITGAEP38570 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
ITGAEP38570 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
ITGAEP38570 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
ITGAEP38570 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
ITGAEP38570 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
ITGAEP38570 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
ITGAEP38570 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
ITGAEP38570 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
ITGAEP38570 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
ITGAEP38570 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
ITGAEP38570 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
ITGAEP38570 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
ITGAEP38570 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
ITGAEP38570 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
ITGAEP38570 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
ITGAEP38570 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
ITGAEP38570 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
ITGAEP38570 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
ITGAEP38570 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
ITGAEP38570 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
ITGAEP38570 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
ITGAEP38570 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
ITGAEP38570 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
ITGAEP38570 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
ITGAEP38570 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
ITGAEP38570 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
ITGAEP38570 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
ITGAEP38570 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
ITGAEP38570 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
ITGAEP38570 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
ITGAEP38570 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
ITGAEP38570 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
ITGAEP38570 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
ITGAEP38570 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
ITGAEP38570 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
ITGAEP38570 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
ITGAEP38570 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
ITGAEP38570 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
ITGAEP38570 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
ITGAEP38570 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
ITGAEP38570 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
ITGAEP38570 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
ITGAEP38570 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
ITGAEP38570 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
ITGAEP38570 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
ITGAEP38570 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
ITGAEP38570 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
ITGAEP38570 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
ITGAEP38570 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
ITGAEP38570 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
ITGAEP38570 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
ITGAEP38570 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
ITGAEP38570 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
ITGAEP38570 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
ITGAEP38570 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
ITGAEP38570 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
ITGAEP38570 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
ITGAEP38570 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
ITGAEP38570 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC27.57■■■□□ 2
ITGAEP38570 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
ITGAEP38570 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
ITGAEP38570 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
ITGAEP38570 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
ITGAEP38570 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
ITGAEP38570 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
ITGAEP38570 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
ITGAEP38570 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
ITGAEP38570 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
ITGAEP38570 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
ITGAEP38570 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
ITGAEP38570 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC27.57■■■□□ 2
ITGAEP38570 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
ITGAEP38570 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
ITGAEP38570 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
ITGAEP38570 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
ITGAEP38570 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
ITGAEP38570 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
ITGAEP38570 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
ITGAEP38570 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
ITGAEP38570 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
ITGAEP38570 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
ITGAEP38570 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
ITGAEP38570 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
ITGAEP38570 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
ITGAEP38570 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
ITGAEP38570 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
ITGAEP38570 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
ITGAEP38570 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
ITGAEP38570 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
ITGAEP38570 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
ITGAEP38570 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
ITGAEP38570 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC27.56■■■□□ 2
ITGAEP38570 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
ITGAEP38570 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
ITGAEP38570 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
ITGAEP38570 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC27.56■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms