Protein–RNA interactions for Protein: P35638

DDIT3, DNA damage-inducible transcript 3 protein, humanhuman

Predictions only

Length 169 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDIT3P35638 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
DDIT3P35638 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
DDIT3P35638 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
DDIT3P35638 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
DDIT3P35638 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
DDIT3P35638 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
DDIT3P35638 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
DDIT3P35638 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
DDIT3P35638 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
DDIT3P35638 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
DDIT3P35638 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
DDIT3P35638 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
DDIT3P35638 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
DDIT3P35638 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
DDIT3P35638 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
DDIT3P35638 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
DDIT3P35638 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
DDIT3P35638 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
DDIT3P35638 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
DDIT3P35638 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
DDIT3P35638 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
DDIT3P35638 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
DDIT3P35638 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
DDIT3P35638 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
DDIT3P35638 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
DDIT3P35638 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
DDIT3P35638 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
DDIT3P35638 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
DDIT3P35638 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
DDIT3P35638 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
DDIT3P35638 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
DDIT3P35638 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
DDIT3P35638 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
DDIT3P35638 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
DDIT3P35638 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
DDIT3P35638 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
DDIT3P35638 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
DDIT3P35638 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
DDIT3P35638 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
DDIT3P35638 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
DDIT3P35638 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
DDIT3P35638 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
DDIT3P35638 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
DDIT3P35638 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
DDIT3P35638 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
DDIT3P35638 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
DDIT3P35638 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
DDIT3P35638 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
DDIT3P35638 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
DDIT3P35638 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
DDIT3P35638 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
DDIT3P35638 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
DDIT3P35638 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
DDIT3P35638 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
DDIT3P35638 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
DDIT3P35638 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
DDIT3P35638 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
DDIT3P35638 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
DDIT3P35638 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
DDIT3P35638 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
DDIT3P35638 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
DDIT3P35638 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
DDIT3P35638 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
DDIT3P35638 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
DDIT3P35638 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
DDIT3P35638 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
DDIT3P35638 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
DDIT3P35638 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
DDIT3P35638 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
DDIT3P35638 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
DDIT3P35638 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
DDIT3P35638 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
DDIT3P35638 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
DDIT3P35638 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
DDIT3P35638 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
DDIT3P35638 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
DDIT3P35638 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
DDIT3P35638 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
DDIT3P35638 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
DDIT3P35638 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
DDIT3P35638 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
DDIT3P35638 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
DDIT3P35638 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
DDIT3P35638 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
DDIT3P35638 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
DDIT3P35638 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
DDIT3P35638 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
DDIT3P35638 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
DDIT3P35638 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
DDIT3P35638 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
DDIT3P35638 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
DDIT3P35638 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
DDIT3P35638 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
DDIT3P35638 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
DDIT3P35638 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
DDIT3P35638 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
DDIT3P35638 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
DDIT3P35638 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
DDIT3P35638 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
DDIT3P35638 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms