Protein–RNA interactions for Protein: P0DMW5

SMIM10L2B, Small integral membrane protein 10-like protein 2B, humanhuman

Predictions only

Length 78 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM10L2BP0DMW5 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SMIM10L2BP0DMW5 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SMIM10L2BP0DMW5 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SMIM10L2BP0DMW5 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SMIM10L2BP0DMW5 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SMIM10L2BP0DMW5 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SMIM10L2BP0DMW5 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SMIM10L2BP0DMW5 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SMIM10L2BP0DMW5 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SMIM10L2BP0DMW5 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SMIM10L2BP0DMW5 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SMIM10L2BP0DMW5 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SMIM10L2BP0DMW5 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SMIM10L2BP0DMW5 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SMIM10L2BP0DMW5 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SMIM10L2BP0DMW5 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SMIM10L2BP0DMW5 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
SMIM10L2BP0DMW5 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SMIM10L2BP0DMW5 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SMIM10L2BP0DMW5 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SMIM10L2BP0DMW5 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
SMIM10L2BP0DMW5 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
SMIM10L2BP0DMW5 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SMIM10L2BP0DMW5 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
SMIM10L2BP0DMW5 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SMIM10L2BP0DMW5 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SMIM10L2BP0DMW5 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
SMIM10L2BP0DMW5 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
SMIM10L2BP0DMW5 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.79
SMIM10L2BP0DMW5 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
SMIM10L2BP0DMW5 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC20.02■□□□□ 0.79
SMIM10L2BP0DMW5 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SMIM10L2BP0DMW5 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SMIM10L2BP0DMW5 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SMIM10L2BP0DMW5 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SMIM10L2BP0DMW5 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SMIM10L2BP0DMW5 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SMIM10L2BP0DMW5 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SMIM10L2BP0DMW5 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SMIM10L2BP0DMW5 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SMIM10L2BP0DMW5 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SMIM10L2BP0DMW5 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SMIM10L2BP0DMW5 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SMIM10L2BP0DMW5 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SMIM10L2BP0DMW5 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SMIM10L2BP0DMW5 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SMIM10L2BP0DMW5 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SMIM10L2BP0DMW5 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SMIM10L2BP0DMW5 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SMIM10L2BP0DMW5 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SMIM10L2BP0DMW5 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
SMIM10L2BP0DMW5 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SMIM10L2BP0DMW5 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
SMIM10L2BP0DMW5 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SMIM10L2BP0DMW5 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SMIM10L2BP0DMW5 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SMIM10L2BP0DMW5 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SMIM10L2BP0DMW5 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SMIM10L2BP0DMW5 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SMIM10L2BP0DMW5 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SMIM10L2BP0DMW5 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SMIM10L2BP0DMW5 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
SMIM10L2BP0DMW5 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SMIM10L2BP0DMW5 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
SMIM10L2BP0DMW5 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SMIM10L2BP0DMW5 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
SMIM10L2BP0DMW5 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
SMIM10L2BP0DMW5 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SMIM10L2BP0DMW5 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC20■□□□□ 0.79
SMIM10L2BP0DMW5 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
SMIM10L2BP0DMW5 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SMIM10L2BP0DMW5 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
SMIM10L2BP0DMW5 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC20■□□□□ 0.79
SMIM10L2BP0DMW5 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
SMIM10L2BP0DMW5 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SMIM10L2BP0DMW5 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
SMIM10L2BP0DMW5 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
SMIM10L2BP0DMW5 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SMIM10L2BP0DMW5 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
SMIM10L2BP0DMW5 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SMIM10L2BP0DMW5 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
SMIM10L2BP0DMW5 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SMIM10L2BP0DMW5 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SMIM10L2BP0DMW5 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SMIM10L2BP0DMW5 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SMIM10L2BP0DMW5 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SMIM10L2BP0DMW5 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SMIM10L2BP0DMW5 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
SMIM10L2BP0DMW5 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SMIM10L2BP0DMW5 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SMIM10L2BP0DMW5 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
SMIM10L2BP0DMW5 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SMIM10L2BP0DMW5 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
SMIM10L2BP0DMW5 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SMIM10L2BP0DMW5 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
SMIM10L2BP0DMW5 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SMIM10L2BP0DMW5 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SMIM10L2BP0DMW5 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SMIM10L2BP0DMW5 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SMIM10L2BP0DMW5 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.6 ms