Protein–RNA interactions for Protein: P0C843

LINC00032, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00032, humanhuman

Predictions only

Length 101 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00032P0C843 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
LINC00032P0C843 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
LINC00032P0C843 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
LINC00032P0C843 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
LINC00032P0C843 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
LINC00032P0C843 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
LINC00032P0C843 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
LINC00032P0C843 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
LINC00032P0C843 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
LINC00032P0C843 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
LINC00032P0C843 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
LINC00032P0C843 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
LINC00032P0C843 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
LINC00032P0C843 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
LINC00032P0C843 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
LINC00032P0C843 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
LINC00032P0C843 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
LINC00032P0C843 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
LINC00032P0C843 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
LINC00032P0C843 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
LINC00032P0C843 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
LINC00032P0C843 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
LINC00032P0C843 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
LINC00032P0C843 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
LINC00032P0C843 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
LINC00032P0C843 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
LINC00032P0C843 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
LINC00032P0C843 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
LINC00032P0C843 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
LINC00032P0C843 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
LINC00032P0C843 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
LINC00032P0C843 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
LINC00032P0C843 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
LINC00032P0C843 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
LINC00032P0C843 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
LINC00032P0C843 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
LINC00032P0C843 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
LINC00032P0C843 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
LINC00032P0C843 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
LINC00032P0C843 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
LINC00032P0C843 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
LINC00032P0C843 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
LINC00032P0C843 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
LINC00032P0C843 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
LINC00032P0C843 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
LINC00032P0C843 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
LINC00032P0C843 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
LINC00032P0C843 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
LINC00032P0C843 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
LINC00032P0C843 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
LINC00032P0C843 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
LINC00032P0C843 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
LINC00032P0C843 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
LINC00032P0C843 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
LINC00032P0C843 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
LINC00032P0C843 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
LINC00032P0C843 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
LINC00032P0C843 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
LINC00032P0C843 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
LINC00032P0C843 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
LINC00032P0C843 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
LINC00032P0C843 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
LINC00032P0C843 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
LINC00032P0C843 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
LINC00032P0C843 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
LINC00032P0C843 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
LINC00032P0C843 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
LINC00032P0C843 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
LINC00032P0C843 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
LINC00032P0C843 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
LINC00032P0C843 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
LINC00032P0C843 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
LINC00032P0C843 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
LINC00032P0C843 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
LINC00032P0C843 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
LINC00032P0C843 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
LINC00032P0C843 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
LINC00032P0C843 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC17.7■□□□□ 0.42
LINC00032P0C843 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
LINC00032P0C843 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
LINC00032P0C843 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
LINC00032P0C843 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
LINC00032P0C843 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
LINC00032P0C843 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
LINC00032P0C843 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
LINC00032P0C843 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
LINC00032P0C843 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
LINC00032P0C843 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
LINC00032P0C843 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
LINC00032P0C843 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
LINC00032P0C843 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
LINC00032P0C843 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
LINC00032P0C843 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
LINC00032P0C843 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
LINC00032P0C843 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
LINC00032P0C843 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
LINC00032P0C843 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
LINC00032P0C843 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
LINC00032P0C843 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
LINC00032P0C843 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.1 ms