Protein–RNA interactions for Protein: P04233

CD74, HLA class II histocompatibility antigen gamma chain, humanhuman

Predictions only

Length 296 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD74P04233 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CD74P04233 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CD74P04233 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CD74P04233 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CD74P04233 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CD74P04233 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CD74P04233 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CD74P04233 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CD74P04233 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CD74P04233 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CD74P04233 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CD74P04233 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CD74P04233 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CD74P04233 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CD74P04233 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CD74P04233 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CD74P04233 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CD74P04233 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CD74P04233 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CD74P04233 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CD74P04233 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CD74P04233 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CD74P04233 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CD74P04233 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CD74P04233 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CD74P04233 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CD74P04233 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CD74P04233 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CD74P04233 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CD74P04233 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CD74P04233 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CD74P04233 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CD74P04233 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CD74P04233 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CD74P04233 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CD74P04233 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CD74P04233 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CD74P04233 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CD74P04233 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CD74P04233 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CD74P04233 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CD74P04233 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CD74P04233 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CD74P04233 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CD74P04233 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CD74P04233 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CD74P04233 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CD74P04233 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CD74P04233 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CD74P04233 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CD74P04233 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CD74P04233 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CD74P04233 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CD74P04233 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CD74P04233 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CD74P04233 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CD74P04233 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CD74P04233 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CD74P04233 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CD74P04233 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CD74P04233 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CD74P04233 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CD74P04233 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CD74P04233 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CD74P04233 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CD74P04233 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CD74P04233 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CD74P04233 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CD74P04233 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CD74P04233 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CD74P04233 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CD74P04233 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CD74P04233 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CD74P04233 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CD74P04233 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CD74P04233 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CD74P04233 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CD74P04233 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CD74P04233 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CD74P04233 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CD74P04233 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CD74P04233 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CD74P04233 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CD74P04233 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CD74P04233 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CD74P04233 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CD74P04233 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CD74P04233 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CD74P04233 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CD74P04233 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CD74P04233 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CD74P04233 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CD74P04233 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CD74P04233 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CD74P04233 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CD74P04233 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CD74P04233 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CD74P04233 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CD74P04233 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CD74P04233 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.2 ms