Protein–RNA interactions for Protein: P02647

APOA1, Apolipoprotein A-I, humanhuman

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOA1P02647 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
APOA1P02647 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
APOA1P02647 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
APOA1P02647 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
APOA1P02647 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
APOA1P02647 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
APOA1P02647 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
APOA1P02647 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
APOA1P02647 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
APOA1P02647 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
APOA1P02647 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
APOA1P02647 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
APOA1P02647 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
APOA1P02647 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
APOA1P02647 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
APOA1P02647 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
APOA1P02647 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
APOA1P02647 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
APOA1P02647 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
APOA1P02647 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
APOA1P02647 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
APOA1P02647 DENND5B-202ENST00000389082 9470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
APOA1P02647 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
APOA1P02647 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
APOA1P02647 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
APOA1P02647 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
APOA1P02647 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
APOA1P02647 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
APOA1P02647 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
APOA1P02647 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
APOA1P02647 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
APOA1P02647 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
APOA1P02647 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
APOA1P02647 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
APOA1P02647 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
APOA1P02647 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
APOA1P02647 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
APOA1P02647 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
APOA1P02647 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
APOA1P02647 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC16.29■□□□□ 0.2
APOA1P02647 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
APOA1P02647 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
APOA1P02647 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
APOA1P02647 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
APOA1P02647 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
APOA1P02647 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
APOA1P02647 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
APOA1P02647 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
APOA1P02647 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
APOA1P02647 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
APOA1P02647 ELFN2-207ENST00000613079 8360 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.29■□□□□ 0.2
APOA1P02647 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
APOA1P02647 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
APOA1P02647 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
APOA1P02647 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
APOA1P02647 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
APOA1P02647 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
APOA1P02647 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
APOA1P02647 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
APOA1P02647 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
APOA1P02647 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
APOA1P02647 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
APOA1P02647 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
APOA1P02647 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
APOA1P02647 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
APOA1P02647 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
APOA1P02647 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
APOA1P02647 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
APOA1P02647 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
APOA1P02647 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
APOA1P02647 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
APOA1P02647 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
APOA1P02647 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
APOA1P02647 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
APOA1P02647 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
APOA1P02647 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
APOA1P02647 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
APOA1P02647 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
APOA1P02647 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
APOA1P02647 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
APOA1P02647 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
APOA1P02647 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
APOA1P02647 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
APOA1P02647 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
APOA1P02647 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
APOA1P02647 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
APOA1P02647 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
APOA1P02647 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
APOA1P02647 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
APOA1P02647 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
APOA1P02647 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
APOA1P02647 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
APOA1P02647 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
APOA1P02647 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
APOA1P02647 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
APOA1P02647 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
APOA1P02647 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
APOA1P02647 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
APOA1P02647 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
APOA1P02647 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms