Protein–RNA interactions for Protein: O43464

HTRA2, Serine protease HTRA2, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTRA2O43464 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HTRA2O43464 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HTRA2O43464 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
HTRA2O43464 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HTRA2O43464 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HTRA2O43464 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HTRA2O43464 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HTRA2O43464 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HTRA2O43464 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HTRA2O43464 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
HTRA2O43464 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HTRA2O43464 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HTRA2O43464 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HTRA2O43464 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HTRA2O43464 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
HTRA2O43464 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HTRA2O43464 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HTRA2O43464 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HTRA2O43464 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HTRA2O43464 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HTRA2O43464 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HTRA2O43464 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HTRA2O43464 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HTRA2O43464 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HTRA2O43464 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HTRA2O43464 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HTRA2O43464 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HTRA2O43464 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HTRA2O43464 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HTRA2O43464 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
HTRA2O43464 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HTRA2O43464 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HTRA2O43464 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HTRA2O43464 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HTRA2O43464 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
HTRA2O43464 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HTRA2O43464 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HTRA2O43464 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HTRA2O43464 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HTRA2O43464 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HTRA2O43464 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HTRA2O43464 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HTRA2O43464 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HTRA2O43464 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HTRA2O43464 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
HTRA2O43464 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HTRA2O43464 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HTRA2O43464 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HTRA2O43464 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HTRA2O43464 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HTRA2O43464 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
HTRA2O43464 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HTRA2O43464 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HTRA2O43464 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
HTRA2O43464 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HTRA2O43464 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
HTRA2O43464 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
HTRA2O43464 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
HTRA2O43464 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HTRA2O43464 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
HTRA2O43464 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
HTRA2O43464 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
HTRA2O43464 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HTRA2O43464 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HTRA2O43464 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
HTRA2O43464 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HTRA2O43464 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
HTRA2O43464 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HTRA2O43464 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HTRA2O43464 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HTRA2O43464 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HTRA2O43464 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HTRA2O43464 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
HTRA2O43464 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
HTRA2O43464 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
HTRA2O43464 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
HTRA2O43464 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
HTRA2O43464 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
HTRA2O43464 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
HTRA2O43464 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.54
HTRA2O43464 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
HTRA2O43464 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
HTRA2O43464 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
HTRA2O43464 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
HTRA2O43464 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
HTRA2O43464 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
HTRA2O43464 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
HTRA2O43464 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
HTRA2O43464 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
HTRA2O43464 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
HTRA2O43464 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
HTRA2O43464 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
HTRA2O43464 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
HTRA2O43464 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
HTRA2O43464 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
HTRA2O43464 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC18.39■□□□□ 0.53
HTRA2O43464 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
HTRA2O43464 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
HTRA2O43464 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
HTRA2O43464 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms