Protein–RNA interactions for Protein: B2RPK0

HMGB1P1, Putative high mobility group protein B1-like 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGB1P1B2RPK0 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
HMGB1P1B2RPK0 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
HMGB1P1B2RPK0 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
HMGB1P1B2RPK0 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HMGB1P1B2RPK0 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
HMGB1P1B2RPK0 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
HMGB1P1B2RPK0 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HMGB1P1B2RPK0 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
HMGB1P1B2RPK0 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HMGB1P1B2RPK0 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
HMGB1P1B2RPK0 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HMGB1P1B2RPK0 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC18.54■□□□□ 0.56
HMGB1P1B2RPK0 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
HMGB1P1B2RPK0 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
HMGB1P1B2RPK0 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
HMGB1P1B2RPK0 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HMGB1P1B2RPK0 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
HMGB1P1B2RPK0 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HMGB1P1B2RPK0 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HMGB1P1B2RPK0 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
HMGB1P1B2RPK0 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HMGB1P1B2RPK0 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
HMGB1P1B2RPK0 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
HMGB1P1B2RPK0 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
HMGB1P1B2RPK0 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
HMGB1P1B2RPK0 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
HMGB1P1B2RPK0 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
HMGB1P1B2RPK0 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
HMGB1P1B2RPK0 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
HMGB1P1B2RPK0 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
HMGB1P1B2RPK0 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
HMGB1P1B2RPK0 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HMGB1P1B2RPK0 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
HMGB1P1B2RPK0 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HMGB1P1B2RPK0 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HMGB1P1B2RPK0 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HMGB1P1B2RPK0 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
HMGB1P1B2RPK0 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HMGB1P1B2RPK0 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
HMGB1P1B2RPK0 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
HMGB1P1B2RPK0 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HMGB1P1B2RPK0 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HMGB1P1B2RPK0 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HMGB1P1B2RPK0 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HMGB1P1B2RPK0 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
HMGB1P1B2RPK0 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HMGB1P1B2RPK0 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HMGB1P1B2RPK0 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HMGB1P1B2RPK0 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
HMGB1P1B2RPK0 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
HMGB1P1B2RPK0 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
HMGB1P1B2RPK0 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
HMGB1P1B2RPK0 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
HMGB1P1B2RPK0 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HMGB1P1B2RPK0 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HMGB1P1B2RPK0 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
HMGB1P1B2RPK0 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HMGB1P1B2RPK0 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
HMGB1P1B2RPK0 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
HMGB1P1B2RPK0 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
HMGB1P1B2RPK0 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
HMGB1P1B2RPK0 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
HMGB1P1B2RPK0 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
HMGB1P1B2RPK0 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
HMGB1P1B2RPK0 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
HMGB1P1B2RPK0 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
HMGB1P1B2RPK0 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
HMGB1P1B2RPK0 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
HMGB1P1B2RPK0 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
HMGB1P1B2RPK0 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
HMGB1P1B2RPK0 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
HMGB1P1B2RPK0 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
HMGB1P1B2RPK0 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
HMGB1P1B2RPK0 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
HMGB1P1B2RPK0 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
HMGB1P1B2RPK0 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
HMGB1P1B2RPK0 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
HMGB1P1B2RPK0 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
HMGB1P1B2RPK0 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
HMGB1P1B2RPK0 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
HMGB1P1B2RPK0 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
HMGB1P1B2RPK0 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
HMGB1P1B2RPK0 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
HMGB1P1B2RPK0 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
HMGB1P1B2RPK0 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
HMGB1P1B2RPK0 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
HMGB1P1B2RPK0 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
HMGB1P1B2RPK0 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
HMGB1P1B2RPK0 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
HMGB1P1B2RPK0 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HMGB1P1B2RPK0 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HMGB1P1B2RPK0 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HMGB1P1B2RPK0 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HMGB1P1B2RPK0 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HMGB1P1B2RPK0 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HMGB1P1B2RPK0 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HMGB1P1B2RPK0 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HMGB1P1B2RPK0 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HMGB1P1B2RPK0 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
HMGB1P1B2RPK0 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms