Protein–RNA interactions for Protein: A2RUR9

CCDC144A, Coiled-coil domain-containing protein 144A, humanhuman

Predictions only

Length 1,427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC144AA2RUR9 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CCDC144AA2RUR9 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CCDC144AA2RUR9 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CCDC144AA2RUR9 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
CCDC144AA2RUR9 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CCDC144AA2RUR9 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CCDC144AA2RUR9 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CCDC144AA2RUR9 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CCDC144AA2RUR9 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CCDC144AA2RUR9 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CCDC144AA2RUR9 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CCDC144AA2RUR9 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CCDC144AA2RUR9 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CCDC144AA2RUR9 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CCDC144AA2RUR9 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CCDC144AA2RUR9 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CCDC144AA2RUR9 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CCDC144AA2RUR9 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CCDC144AA2RUR9 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CCDC144AA2RUR9 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CCDC144AA2RUR9 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CCDC144AA2RUR9 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CCDC144AA2RUR9 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CCDC144AA2RUR9 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CCDC144AA2RUR9 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CCDC144AA2RUR9 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CCDC144AA2RUR9 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CCDC144AA2RUR9 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CCDC144AA2RUR9 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
CCDC144AA2RUR9 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CCDC144AA2RUR9 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CCDC144AA2RUR9 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CCDC144AA2RUR9 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CCDC144AA2RUR9 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CCDC144AA2RUR9 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CCDC144AA2RUR9 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CCDC144AA2RUR9 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CCDC144AA2RUR9 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CCDC144AA2RUR9 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CCDC144AA2RUR9 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CCDC144AA2RUR9 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CCDC144AA2RUR9 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CCDC144AA2RUR9 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CCDC144AA2RUR9 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CCDC144AA2RUR9 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CCDC144AA2RUR9 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CCDC144AA2RUR9 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CCDC144AA2RUR9 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CCDC144AA2RUR9 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CCDC144AA2RUR9 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
CCDC144AA2RUR9 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
CCDC144AA2RUR9 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
CCDC144AA2RUR9 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CCDC144AA2RUR9 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CCDC144AA2RUR9 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CCDC144AA2RUR9 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CCDC144AA2RUR9 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CCDC144AA2RUR9 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CCDC144AA2RUR9 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CCDC144AA2RUR9 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CCDC144AA2RUR9 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CCDC144AA2RUR9 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CCDC144AA2RUR9 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CCDC144AA2RUR9 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CCDC144AA2RUR9 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CCDC144AA2RUR9 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CCDC144AA2RUR9 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CCDC144AA2RUR9 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CCDC144AA2RUR9 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
CCDC144AA2RUR9 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
CCDC144AA2RUR9 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CCDC144AA2RUR9 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CCDC144AA2RUR9 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
CCDC144AA2RUR9 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CCDC144AA2RUR9 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
CCDC144AA2RUR9 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CCDC144AA2RUR9 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CCDC144AA2RUR9 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CCDC144AA2RUR9 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CCDC144AA2RUR9 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CCDC144AA2RUR9 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CCDC144AA2RUR9 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CCDC144AA2RUR9 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CCDC144AA2RUR9 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CCDC144AA2RUR9 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CCDC144AA2RUR9 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
CCDC144AA2RUR9 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
CCDC144AA2RUR9 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CCDC144AA2RUR9 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CCDC144AA2RUR9 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CCDC144AA2RUR9 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CCDC144AA2RUR9 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CCDC144AA2RUR9 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
CCDC144AA2RUR9 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
CCDC144AA2RUR9 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
CCDC144AA2RUR9 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CCDC144AA2RUR9 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CCDC144AA2RUR9 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CCDC144AA2RUR9 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CCDC144AA2RUR9 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms