Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6R4

MAP3K4, Mitogen-activated protein kinase kinase kinase 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,608 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAP3K4Q9Y6R4 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
MAP3K4Q9Y6R4 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
MAP3K4Q9Y6R4 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
MAP3K4Q9Y6R4 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
MAP3K4Q9Y6R4 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
MAP3K4Q9Y6R4 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
MAP3K4Q9Y6R4 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
MAP3K4Q9Y6R4 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
MAP3K4Q9Y6R4 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC27.69■■■□□ 2.02
MAP3K4Q9Y6R4 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
MAP3K4Q9Y6R4 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
MAP3K4Q9Y6R4 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
MAP3K4Q9Y6R4 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
MAP3K4Q9Y6R4 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
MAP3K4Q9Y6R4 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
MAP3K4Q9Y6R4 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
MAP3K4Q9Y6R4 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
MAP3K4Q9Y6R4 AL451067.1-201ENST00000453111 394 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
MAP3K4Q9Y6R4 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
MAP3K4Q9Y6R4 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
MAP3K4Q9Y6R4 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
MAP3K4Q9Y6R4 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
MAP3K4Q9Y6R4 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
MAP3K4Q9Y6R4 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.68■■■□□ 2.02
MAP3K4Q9Y6R4 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
MAP3K4Q9Y6R4 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
MAP3K4Q9Y6R4 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
MAP3K4Q9Y6R4 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
MAP3K4Q9Y6R4 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
MAP3K4Q9Y6R4 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
MAP3K4Q9Y6R4 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
MAP3K4Q9Y6R4 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC27.67■■■□□ 2.02
MAP3K4Q9Y6R4 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
MAP3K4Q9Y6R4 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
MAP3K4Q9Y6R4 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
MAP3K4Q9Y6R4 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
MAP3K4Q9Y6R4 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
MAP3K4Q9Y6R4 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
MAP3K4Q9Y6R4 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
MAP3K4Q9Y6R4 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
MAP3K4Q9Y6R4 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
MAP3K4Q9Y6R4 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
MAP3K4Q9Y6R4 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
MAP3K4Q9Y6R4 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
MAP3K4Q9Y6R4 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
MAP3K4Q9Y6R4 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
MAP3K4Q9Y6R4 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
MAP3K4Q9Y6R4 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
MAP3K4Q9Y6R4 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
MAP3K4Q9Y6R4 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
MAP3K4Q9Y6R4 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
MAP3K4Q9Y6R4 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
MAP3K4Q9Y6R4 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC27.67■■■□□ 2.02
MAP3K4Q9Y6R4 PPP1R14A-203ENST00000587515 607 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
MAP3K4Q9Y6R4 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
MAP3K4Q9Y6R4 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
MAP3K4Q9Y6R4 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
MAP3K4Q9Y6R4 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
MAP3K4Q9Y6R4 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
MAP3K4Q9Y6R4 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
MAP3K4Q9Y6R4 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
MAP3K4Q9Y6R4 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
MAP3K4Q9Y6R4 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
MAP3K4Q9Y6R4 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
MAP3K4Q9Y6R4 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
MAP3K4Q9Y6R4 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
MAP3K4Q9Y6R4 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
MAP3K4Q9Y6R4 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
MAP3K4Q9Y6R4 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
MAP3K4Q9Y6R4 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
MAP3K4Q9Y6R4 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
MAP3K4Q9Y6R4 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
MAP3K4Q9Y6R4 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
MAP3K4Q9Y6R4 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
MAP3K4Q9Y6R4 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
MAP3K4Q9Y6R4 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
MAP3K4Q9Y6R4 AC005034.1-201ENST00000426657 489 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
MAP3K4Q9Y6R4 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
MAP3K4Q9Y6R4 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
MAP3K4Q9Y6R4 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
MAP3K4Q9Y6R4 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC27.65■■■□□ 2.02
MAP3K4Q9Y6R4 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
MAP3K4Q9Y6R4 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
MAP3K4Q9Y6R4 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
MAP3K4Q9Y6R4 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
MAP3K4Q9Y6R4 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
MAP3K4Q9Y6R4 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
MAP3K4Q9Y6R4 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
MAP3K4Q9Y6R4 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
MAP3K4Q9Y6R4 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
MAP3K4Q9Y6R4 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
MAP3K4Q9Y6R4 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
MAP3K4Q9Y6R4 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
MAP3K4Q9Y6R4 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
MAP3K4Q9Y6R4 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
MAP3K4Q9Y6R4 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
MAP3K4Q9Y6R4 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
MAP3K4Q9Y6R4 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
MAP3K4Q9Y6R4 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
MAP3K4Q9Y6R4 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms