Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2H5

USP35, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 35, humanhuman

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Length 1,018 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP35Q9P2H5 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC24.62■■□□□ 1.53
USP35Q9P2H5 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
USP35Q9P2H5 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
USP35Q9P2H5 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
USP35Q9P2H5 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
USP35Q9P2H5 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
USP35Q9P2H5 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
USP35Q9P2H5 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
USP35Q9P2H5 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
USP35Q9P2H5 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
USP35Q9P2H5 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
USP35Q9P2H5 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
USP35Q9P2H5 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
USP35Q9P2H5 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
USP35Q9P2H5 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
USP35Q9P2H5 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
USP35Q9P2H5 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
USP35Q9P2H5 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
USP35Q9P2H5 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
USP35Q9P2H5 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
USP35Q9P2H5 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
USP35Q9P2H5 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
USP35Q9P2H5 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
USP35Q9P2H5 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
USP35Q9P2H5 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
USP35Q9P2H5 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC24.61■■□□□ 1.53
USP35Q9P2H5 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
USP35Q9P2H5 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC24.61■■□□□ 1.53
USP35Q9P2H5 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
USP35Q9P2H5 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
USP35Q9P2H5 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
USP35Q9P2H5 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
USP35Q9P2H5 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
USP35Q9P2H5 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
USP35Q9P2H5 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
USP35Q9P2H5 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
USP35Q9P2H5 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
USP35Q9P2H5 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
USP35Q9P2H5 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
USP35Q9P2H5 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
USP35Q9P2H5 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
USP35Q9P2H5 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
USP35Q9P2H5 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
USP35Q9P2H5 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
USP35Q9P2H5 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
USP35Q9P2H5 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC24.6■■□□□ 1.53
USP35Q9P2H5 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
USP35Q9P2H5 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
USP35Q9P2H5 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
USP35Q9P2H5 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
USP35Q9P2H5 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
USP35Q9P2H5 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
USP35Q9P2H5 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
USP35Q9P2H5 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
USP35Q9P2H5 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
USP35Q9P2H5 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
USP35Q9P2H5 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
USP35Q9P2H5 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
USP35Q9P2H5 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
USP35Q9P2H5 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
USP35Q9P2H5 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
USP35Q9P2H5 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
USP35Q9P2H5 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
USP35Q9P2H5 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
USP35Q9P2H5 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
USP35Q9P2H5 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
USP35Q9P2H5 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
USP35Q9P2H5 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
USP35Q9P2H5 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
USP35Q9P2H5 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC24.59■■□□□ 1.53
USP35Q9P2H5 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
USP35Q9P2H5 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC24.59■■□□□ 1.53
USP35Q9P2H5 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
USP35Q9P2H5 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
USP35Q9P2H5 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
USP35Q9P2H5 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
USP35Q9P2H5 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
USP35Q9P2H5 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
USP35Q9P2H5 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
USP35Q9P2H5 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
USP35Q9P2H5 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
USP35Q9P2H5 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
USP35Q9P2H5 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
USP35Q9P2H5 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
USP35Q9P2H5 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
USP35Q9P2H5 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
USP35Q9P2H5 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
USP35Q9P2H5 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
USP35Q9P2H5 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
USP35Q9P2H5 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
USP35Q9P2H5 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
USP35Q9P2H5 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
USP35Q9P2H5 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
USP35Q9P2H5 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
USP35Q9P2H5 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
USP35Q9P2H5 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
USP35Q9P2H5 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
USP35Q9P2H5 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
USP35Q9P2H5 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
USP35Q9P2H5 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
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