Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZZ3

CHMP5, Charged multivesicular body protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMP5Q9NZZ3 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CHMP5Q9NZZ3 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CHMP5Q9NZZ3 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CHMP5Q9NZZ3 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CHMP5Q9NZZ3 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CHMP5Q9NZZ3 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CHMP5Q9NZZ3 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CHMP5Q9NZZ3 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CHMP5Q9NZZ3 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CHMP5Q9NZZ3 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CHMP5Q9NZZ3 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CHMP5Q9NZZ3 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CHMP5Q9NZZ3 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CHMP5Q9NZZ3 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CHMP5Q9NZZ3 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CHMP5Q9NZZ3 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CHMP5Q9NZZ3 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CHMP5Q9NZZ3 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CHMP5Q9NZZ3 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CHMP5Q9NZZ3 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CHMP5Q9NZZ3 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CHMP5Q9NZZ3 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CHMP5Q9NZZ3 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CHMP5Q9NZZ3 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CHMP5Q9NZZ3 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CHMP5Q9NZZ3 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CHMP5Q9NZZ3 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CHMP5Q9NZZ3 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CHMP5Q9NZZ3 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CHMP5Q9NZZ3 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CHMP5Q9NZZ3 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CHMP5Q9NZZ3 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CHMP5Q9NZZ3 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CHMP5Q9NZZ3 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CHMP5Q9NZZ3 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CHMP5Q9NZZ3 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CHMP5Q9NZZ3 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CHMP5Q9NZZ3 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CHMP5Q9NZZ3 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CHMP5Q9NZZ3 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CHMP5Q9NZZ3 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CHMP5Q9NZZ3 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CHMP5Q9NZZ3 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CHMP5Q9NZZ3 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CHMP5Q9NZZ3 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CHMP5Q9NZZ3 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CHMP5Q9NZZ3 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CHMP5Q9NZZ3 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
CHMP5Q9NZZ3 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CHMP5Q9NZZ3 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CHMP5Q9NZZ3 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
CHMP5Q9NZZ3 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CHMP5Q9NZZ3 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CHMP5Q9NZZ3 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CHMP5Q9NZZ3 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CHMP5Q9NZZ3 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CHMP5Q9NZZ3 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CHMP5Q9NZZ3 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CHMP5Q9NZZ3 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CHMP5Q9NZZ3 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CHMP5Q9NZZ3 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CHMP5Q9NZZ3 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CHMP5Q9NZZ3 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CHMP5Q9NZZ3 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CHMP5Q9NZZ3 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CHMP5Q9NZZ3 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CHMP5Q9NZZ3 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CHMP5Q9NZZ3 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CHMP5Q9NZZ3 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CHMP5Q9NZZ3 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CHMP5Q9NZZ3 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CHMP5Q9NZZ3 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CHMP5Q9NZZ3 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CHMP5Q9NZZ3 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CHMP5Q9NZZ3 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CHMP5Q9NZZ3 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CHMP5Q9NZZ3 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CHMP5Q9NZZ3 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CHMP5Q9NZZ3 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CHMP5Q9NZZ3 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CHMP5Q9NZZ3 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CHMP5Q9NZZ3 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CHMP5Q9NZZ3 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CHMP5Q9NZZ3 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CHMP5Q9NZZ3 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CHMP5Q9NZZ3 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CHMP5Q9NZZ3 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CHMP5Q9NZZ3 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CHMP5Q9NZZ3 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CHMP5Q9NZZ3 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CHMP5Q9NZZ3 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CHMP5Q9NZZ3 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CHMP5Q9NZZ3 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CHMP5Q9NZZ3 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CHMP5Q9NZZ3 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CHMP5Q9NZZ3 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CHMP5Q9NZZ3 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CHMP5Q9NZZ3 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CHMP5Q9NZZ3 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CHMP5Q9NZZ3 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms