Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRP4

SDHAF3, Succinate dehydrogenase assembly factor 3, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDHAF3Q9NRP4 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SDHAF3Q9NRP4 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SDHAF3Q9NRP4 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SDHAF3Q9NRP4 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SDHAF3Q9NRP4 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SDHAF3Q9NRP4 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SDHAF3Q9NRP4 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SDHAF3Q9NRP4 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SDHAF3Q9NRP4 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SDHAF3Q9NRP4 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
SDHAF3Q9NRP4 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SDHAF3Q9NRP4 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SDHAF3Q9NRP4 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SDHAF3Q9NRP4 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SDHAF3Q9NRP4 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SDHAF3Q9NRP4 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SDHAF3Q9NRP4 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SDHAF3Q9NRP4 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SDHAF3Q9NRP4 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SDHAF3Q9NRP4 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
SDHAF3Q9NRP4 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SDHAF3Q9NRP4 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SDHAF3Q9NRP4 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SDHAF3Q9NRP4 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
SDHAF3Q9NRP4 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SDHAF3Q9NRP4 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SDHAF3Q9NRP4 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SDHAF3Q9NRP4 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SDHAF3Q9NRP4 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SDHAF3Q9NRP4 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SDHAF3Q9NRP4 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SDHAF3Q9NRP4 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SDHAF3Q9NRP4 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SDHAF3Q9NRP4 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SDHAF3Q9NRP4 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SDHAF3Q9NRP4 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SDHAF3Q9NRP4 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SDHAF3Q9NRP4 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SDHAF3Q9NRP4 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SDHAF3Q9NRP4 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SDHAF3Q9NRP4 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SDHAF3Q9NRP4 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SDHAF3Q9NRP4 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SDHAF3Q9NRP4 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SDHAF3Q9NRP4 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SDHAF3Q9NRP4 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SDHAF3Q9NRP4 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SDHAF3Q9NRP4 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SDHAF3Q9NRP4 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SDHAF3Q9NRP4 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SDHAF3Q9NRP4 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SDHAF3Q9NRP4 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SDHAF3Q9NRP4 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SDHAF3Q9NRP4 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SDHAF3Q9NRP4 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
SDHAF3Q9NRP4 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SDHAF3Q9NRP4 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SDHAF3Q9NRP4 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SDHAF3Q9NRP4 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
SDHAF3Q9NRP4 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
SDHAF3Q9NRP4 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SDHAF3Q9NRP4 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SDHAF3Q9NRP4 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SDHAF3Q9NRP4 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SDHAF3Q9NRP4 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SDHAF3Q9NRP4 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SDHAF3Q9NRP4 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SDHAF3Q9NRP4 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
SDHAF3Q9NRP4 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SDHAF3Q9NRP4 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SDHAF3Q9NRP4 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SDHAF3Q9NRP4 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SDHAF3Q9NRP4 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SDHAF3Q9NRP4 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SDHAF3Q9NRP4 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SDHAF3Q9NRP4 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SDHAF3Q9NRP4 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SDHAF3Q9NRP4 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SDHAF3Q9NRP4 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SDHAF3Q9NRP4 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SDHAF3Q9NRP4 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SDHAF3Q9NRP4 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SDHAF3Q9NRP4 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SDHAF3Q9NRP4 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SDHAF3Q9NRP4 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
SDHAF3Q9NRP4 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SDHAF3Q9NRP4 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
SDHAF3Q9NRP4 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SDHAF3Q9NRP4 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SDHAF3Q9NRP4 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SDHAF3Q9NRP4 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SDHAF3Q9NRP4 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SDHAF3Q9NRP4 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SDHAF3Q9NRP4 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SDHAF3Q9NRP4 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SDHAF3Q9NRP4 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SDHAF3Q9NRP4 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
SDHAF3Q9NRP4 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SDHAF3Q9NRP4 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SDHAF3Q9NRP4 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.3 ms