Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZ95

NSD3, Histone-lysine N-methyltransferase NSD3, humanhuman

Predictions only

Length 1,437 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NSD3Q9BZ95 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NSD3Q9BZ95 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
NSD3Q9BZ95 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NSD3Q9BZ95 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NSD3Q9BZ95 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NSD3Q9BZ95 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
NSD3Q9BZ95 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NSD3Q9BZ95 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NSD3Q9BZ95 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
NSD3Q9BZ95 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
NSD3Q9BZ95 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NSD3Q9BZ95 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
NSD3Q9BZ95 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NSD3Q9BZ95 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NSD3Q9BZ95 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
NSD3Q9BZ95 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
NSD3Q9BZ95 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
NSD3Q9BZ95 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC24.7■■□□□ 1.55
NSD3Q9BZ95 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
NSD3Q9BZ95 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
NSD3Q9BZ95 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
NSD3Q9BZ95 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
NSD3Q9BZ95 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
NSD3Q9BZ95 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
NSD3Q9BZ95 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
NSD3Q9BZ95 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
NSD3Q9BZ95 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
NSD3Q9BZ95 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
NSD3Q9BZ95 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC24.7■■□□□ 1.54
NSD3Q9BZ95 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
NSD3Q9BZ95 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
NSD3Q9BZ95 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
NSD3Q9BZ95 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
NSD3Q9BZ95 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NSD3Q9BZ95 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NSD3Q9BZ95 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
NSD3Q9BZ95 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NSD3Q9BZ95 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NSD3Q9BZ95 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NSD3Q9BZ95 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NSD3Q9BZ95 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NSD3Q9BZ95 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NSD3Q9BZ95 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NSD3Q9BZ95 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NSD3Q9BZ95 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NSD3Q9BZ95 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NSD3Q9BZ95 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NSD3Q9BZ95 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NSD3Q9BZ95 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NSD3Q9BZ95 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NSD3Q9BZ95 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NSD3Q9BZ95 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NSD3Q9BZ95 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NSD3Q9BZ95 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NSD3Q9BZ95 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NSD3Q9BZ95 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NSD3Q9BZ95 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NSD3Q9BZ95 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NSD3Q9BZ95 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NSD3Q9BZ95 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NSD3Q9BZ95 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NSD3Q9BZ95 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
NSD3Q9BZ95 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NSD3Q9BZ95 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NSD3Q9BZ95 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NSD3Q9BZ95 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
NSD3Q9BZ95 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NSD3Q9BZ95 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
NSD3Q9BZ95 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
NSD3Q9BZ95 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NSD3Q9BZ95 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NSD3Q9BZ95 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NSD3Q9BZ95 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NSD3Q9BZ95 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NSD3Q9BZ95 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
NSD3Q9BZ95 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
NSD3Q9BZ95 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
NSD3Q9BZ95 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
NSD3Q9BZ95 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
NSD3Q9BZ95 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NSD3Q9BZ95 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
NSD3Q9BZ95 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NSD3Q9BZ95 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NSD3Q9BZ95 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NSD3Q9BZ95 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
NSD3Q9BZ95 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NSD3Q9BZ95 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
NSD3Q9BZ95 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
NSD3Q9BZ95 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NSD3Q9BZ95 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NSD3Q9BZ95 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NSD3Q9BZ95 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NSD3Q9BZ95 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NSD3Q9BZ95 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
NSD3Q9BZ95 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
NSD3Q9BZ95 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NSD3Q9BZ95 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NSD3Q9BZ95 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NSD3Q9BZ95 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
NSD3Q9BZ95 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms