Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY66

KDM5D, Lysine-specific demethylase 5D, humanhuman

Predictions only

Length 1,539 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM5DQ9BY66 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
KDM5DQ9BY66 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
KDM5DQ9BY66 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
KDM5DQ9BY66 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
KDM5DQ9BY66 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
KDM5DQ9BY66 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
KDM5DQ9BY66 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
KDM5DQ9BY66 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
KDM5DQ9BY66 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
KDM5DQ9BY66 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
KDM5DQ9BY66 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC26.86■■□□□ 1.89
KDM5DQ9BY66 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
KDM5DQ9BY66 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
KDM5DQ9BY66 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
KDM5DQ9BY66 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
KDM5DQ9BY66 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
KDM5DQ9BY66 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
KDM5DQ9BY66 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
KDM5DQ9BY66 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
KDM5DQ9BY66 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
KDM5DQ9BY66 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
KDM5DQ9BY66 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
KDM5DQ9BY66 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
KDM5DQ9BY66 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
KDM5DQ9BY66 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
KDM5DQ9BY66 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
KDM5DQ9BY66 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
KDM5DQ9BY66 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
KDM5DQ9BY66 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
KDM5DQ9BY66 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
KDM5DQ9BY66 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
KDM5DQ9BY66 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
KDM5DQ9BY66 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
KDM5DQ9BY66 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
KDM5DQ9BY66 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
KDM5DQ9BY66 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
KDM5DQ9BY66 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
KDM5DQ9BY66 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
KDM5DQ9BY66 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
KDM5DQ9BY66 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
KDM5DQ9BY66 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
KDM5DQ9BY66 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
KDM5DQ9BY66 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
KDM5DQ9BY66 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
KDM5DQ9BY66 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
KDM5DQ9BY66 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
KDM5DQ9BY66 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
KDM5DQ9BY66 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
KDM5DQ9BY66 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
KDM5DQ9BY66 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
KDM5DQ9BY66 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
KDM5DQ9BY66 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
KDM5DQ9BY66 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
KDM5DQ9BY66 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
KDM5DQ9BY66 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
KDM5DQ9BY66 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
KDM5DQ9BY66 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
KDM5DQ9BY66 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
KDM5DQ9BY66 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
KDM5DQ9BY66 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
KDM5DQ9BY66 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
KDM5DQ9BY66 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
KDM5DQ9BY66 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
KDM5DQ9BY66 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
KDM5DQ9BY66 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
KDM5DQ9BY66 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
KDM5DQ9BY66 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
KDM5DQ9BY66 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
KDM5DQ9BY66 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
KDM5DQ9BY66 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
KDM5DQ9BY66 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
KDM5DQ9BY66 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
KDM5DQ9BY66 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC26.83■■□□□ 1.89
KDM5DQ9BY66 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC26.83■■□□□ 1.89
KDM5DQ9BY66 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
KDM5DQ9BY66 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
KDM5DQ9BY66 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
KDM5DQ9BY66 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
KDM5DQ9BY66 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
KDM5DQ9BY66 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
KDM5DQ9BY66 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
KDM5DQ9BY66 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
KDM5DQ9BY66 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
KDM5DQ9BY66 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
KDM5DQ9BY66 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
KDM5DQ9BY66 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
KDM5DQ9BY66 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
KDM5DQ9BY66 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
KDM5DQ9BY66 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
KDM5DQ9BY66 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
KDM5DQ9BY66 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
KDM5DQ9BY66 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
KDM5DQ9BY66 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
KDM5DQ9BY66 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
KDM5DQ9BY66 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
KDM5DQ9BY66 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
KDM5DQ9BY66 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
KDM5DQ9BY66 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
KDM5DQ9BY66 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
KDM5DQ9BY66 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms