Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSH5

HDHD3, Haloacid dehalogenase-like hydrolase domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 251 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDHD3Q9BSH5 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
HDHD3Q9BSH5 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
HDHD3Q9BSH5 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
HDHD3Q9BSH5 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
HDHD3Q9BSH5 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
HDHD3Q9BSH5 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
HDHD3Q9BSH5 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
HDHD3Q9BSH5 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HDHD3Q9BSH5 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HDHD3Q9BSH5 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HDHD3Q9BSH5 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HDHD3Q9BSH5 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HDHD3Q9BSH5 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HDHD3Q9BSH5 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HDHD3Q9BSH5 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
HDHD3Q9BSH5 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HDHD3Q9BSH5 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HDHD3Q9BSH5 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HDHD3Q9BSH5 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HDHD3Q9BSH5 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HDHD3Q9BSH5 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HDHD3Q9BSH5 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HDHD3Q9BSH5 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
HDHD3Q9BSH5 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HDHD3Q9BSH5 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HDHD3Q9BSH5 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HDHD3Q9BSH5 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HDHD3Q9BSH5 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HDHD3Q9BSH5 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HDHD3Q9BSH5 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HDHD3Q9BSH5 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HDHD3Q9BSH5 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HDHD3Q9BSH5 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HDHD3Q9BSH5 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HDHD3Q9BSH5 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HDHD3Q9BSH5 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HDHD3Q9BSH5 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HDHD3Q9BSH5 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HDHD3Q9BSH5 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HDHD3Q9BSH5 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HDHD3Q9BSH5 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HDHD3Q9BSH5 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HDHD3Q9BSH5 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
HDHD3Q9BSH5 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HDHD3Q9BSH5 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HDHD3Q9BSH5 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HDHD3Q9BSH5 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HDHD3Q9BSH5 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HDHD3Q9BSH5 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HDHD3Q9BSH5 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
HDHD3Q9BSH5 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
HDHD3Q9BSH5 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
HDHD3Q9BSH5 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HDHD3Q9BSH5 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HDHD3Q9BSH5 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HDHD3Q9BSH5 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HDHD3Q9BSH5 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HDHD3Q9BSH5 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HDHD3Q9BSH5 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HDHD3Q9BSH5 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HDHD3Q9BSH5 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HDHD3Q9BSH5 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HDHD3Q9BSH5 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HDHD3Q9BSH5 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HDHD3Q9BSH5 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HDHD3Q9BSH5 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HDHD3Q9BSH5 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HDHD3Q9BSH5 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HDHD3Q9BSH5 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HDHD3Q9BSH5 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HDHD3Q9BSH5 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HDHD3Q9BSH5 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HDHD3Q9BSH5 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
HDHD3Q9BSH5 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HDHD3Q9BSH5 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HDHD3Q9BSH5 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HDHD3Q9BSH5 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HDHD3Q9BSH5 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HDHD3Q9BSH5 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HDHD3Q9BSH5 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HDHD3Q9BSH5 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HDHD3Q9BSH5 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HDHD3Q9BSH5 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HDHD3Q9BSH5 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HDHD3Q9BSH5 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HDHD3Q9BSH5 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HDHD3Q9BSH5 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HDHD3Q9BSH5 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HDHD3Q9BSH5 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
HDHD3Q9BSH5 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
HDHD3Q9BSH5 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HDHD3Q9BSH5 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HDHD3Q9BSH5 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HDHD3Q9BSH5 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HDHD3Q9BSH5 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HDHD3Q9BSH5 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HDHD3Q9BSH5 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HDHD3Q9BSH5 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HDHD3Q9BSH5 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HDHD3Q9BSH5 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms