Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRL7

SEC22C, Vesicle-trafficking protein SEC22c, humanhuman

Predictions only

Length 303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC22CQ9BRL7 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SEC22CQ9BRL7 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SEC22CQ9BRL7 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SEC22CQ9BRL7 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SEC22CQ9BRL7 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SEC22CQ9BRL7 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SEC22CQ9BRL7 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SEC22CQ9BRL7 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SEC22CQ9BRL7 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SEC22CQ9BRL7 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SEC22CQ9BRL7 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SEC22CQ9BRL7 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SEC22CQ9BRL7 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SEC22CQ9BRL7 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SEC22CQ9BRL7 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SEC22CQ9BRL7 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SEC22CQ9BRL7 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SEC22CQ9BRL7 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SEC22CQ9BRL7 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SEC22CQ9BRL7 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SEC22CQ9BRL7 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SEC22CQ9BRL7 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SEC22CQ9BRL7 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SEC22CQ9BRL7 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SEC22CQ9BRL7 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SEC22CQ9BRL7 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SEC22CQ9BRL7 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SEC22CQ9BRL7 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SEC22CQ9BRL7 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SEC22CQ9BRL7 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SEC22CQ9BRL7 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SEC22CQ9BRL7 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SEC22CQ9BRL7 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SEC22CQ9BRL7 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SEC22CQ9BRL7 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SEC22CQ9BRL7 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SEC22CQ9BRL7 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SEC22CQ9BRL7 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SEC22CQ9BRL7 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SEC22CQ9BRL7 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SEC22CQ9BRL7 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SEC22CQ9BRL7 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SEC22CQ9BRL7 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SEC22CQ9BRL7 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SEC22CQ9BRL7 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SEC22CQ9BRL7 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SEC22CQ9BRL7 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SEC22CQ9BRL7 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SEC22CQ9BRL7 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SEC22CQ9BRL7 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SEC22CQ9BRL7 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SEC22CQ9BRL7 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SEC22CQ9BRL7 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SEC22CQ9BRL7 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SEC22CQ9BRL7 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SEC22CQ9BRL7 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SEC22CQ9BRL7 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SEC22CQ9BRL7 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SEC22CQ9BRL7 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SEC22CQ9BRL7 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SEC22CQ9BRL7 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SEC22CQ9BRL7 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SEC22CQ9BRL7 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
SEC22CQ9BRL7 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SEC22CQ9BRL7 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SEC22CQ9BRL7 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SEC22CQ9BRL7 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SEC22CQ9BRL7 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SEC22CQ9BRL7 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SEC22CQ9BRL7 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SEC22CQ9BRL7 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SEC22CQ9BRL7 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SEC22CQ9BRL7 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SEC22CQ9BRL7 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SEC22CQ9BRL7 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SEC22CQ9BRL7 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SEC22CQ9BRL7 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SEC22CQ9BRL7 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SEC22CQ9BRL7 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SEC22CQ9BRL7 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SEC22CQ9BRL7 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SEC22CQ9BRL7 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SEC22CQ9BRL7 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SEC22CQ9BRL7 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SEC22CQ9BRL7 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SEC22CQ9BRL7 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SEC22CQ9BRL7 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SEC22CQ9BRL7 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SEC22CQ9BRL7 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SEC22CQ9BRL7 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SEC22CQ9BRL7 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SEC22CQ9BRL7 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SEC22CQ9BRL7 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SEC22CQ9BRL7 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SEC22CQ9BRL7 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SEC22CQ9BRL7 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SEC22CQ9BRL7 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SEC22CQ9BRL7 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SEC22CQ9BRL7 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SEC22CQ9BRL7 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.3 ms