Protein–RNA interactions for Protein: Q96SD1

DCLRE1C, Protein artemis, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 692 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCLRE1CQ96SD1 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
DCLRE1CQ96SD1 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
DCLRE1CQ96SD1 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
DCLRE1CQ96SD1 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
DCLRE1CQ96SD1 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
DCLRE1CQ96SD1 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
DCLRE1CQ96SD1 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
DCLRE1CQ96SD1 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
DCLRE1CQ96SD1 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
DCLRE1CQ96SD1 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
DCLRE1CQ96SD1 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
DCLRE1CQ96SD1 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
DCLRE1CQ96SD1 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
DCLRE1CQ96SD1 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
DCLRE1CQ96SD1 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
DCLRE1CQ96SD1 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
DCLRE1CQ96SD1 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
DCLRE1CQ96SD1 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
DCLRE1CQ96SD1 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
DCLRE1CQ96SD1 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
DCLRE1CQ96SD1 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
DCLRE1CQ96SD1 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
DCLRE1CQ96SD1 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
DCLRE1CQ96SD1 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
DCLRE1CQ96SD1 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
DCLRE1CQ96SD1 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
DCLRE1CQ96SD1 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
DCLRE1CQ96SD1 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
DCLRE1CQ96SD1 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
DCLRE1CQ96SD1 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
DCLRE1CQ96SD1 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
DCLRE1CQ96SD1 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
DCLRE1CQ96SD1 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
DCLRE1CQ96SD1 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
DCLRE1CQ96SD1 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
DCLRE1CQ96SD1 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
DCLRE1CQ96SD1 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
DCLRE1CQ96SD1 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
DCLRE1CQ96SD1 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
DCLRE1CQ96SD1 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
DCLRE1CQ96SD1 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
DCLRE1CQ96SD1 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
DCLRE1CQ96SD1 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
DCLRE1CQ96SD1 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
DCLRE1CQ96SD1 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
DCLRE1CQ96SD1 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
DCLRE1CQ96SD1 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
DCLRE1CQ96SD1 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
DCLRE1CQ96SD1 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
DCLRE1CQ96SD1 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
DCLRE1CQ96SD1 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
DCLRE1CQ96SD1 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
DCLRE1CQ96SD1 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
DCLRE1CQ96SD1 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
DCLRE1CQ96SD1 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
DCLRE1CQ96SD1 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
DCLRE1CQ96SD1 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
DCLRE1CQ96SD1 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
DCLRE1CQ96SD1 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
DCLRE1CQ96SD1 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
DCLRE1CQ96SD1 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
DCLRE1CQ96SD1 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
DCLRE1CQ96SD1 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
DCLRE1CQ96SD1 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
DCLRE1CQ96SD1 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
DCLRE1CQ96SD1 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
DCLRE1CQ96SD1 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
DCLRE1CQ96SD1 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
DCLRE1CQ96SD1 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
DCLRE1CQ96SD1 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
DCLRE1CQ96SD1 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
DCLRE1CQ96SD1 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
DCLRE1CQ96SD1 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
DCLRE1CQ96SD1 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
DCLRE1CQ96SD1 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
DCLRE1CQ96SD1 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
DCLRE1CQ96SD1 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
DCLRE1CQ96SD1 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
DCLRE1CQ96SD1 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
DCLRE1CQ96SD1 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
DCLRE1CQ96SD1 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
DCLRE1CQ96SD1 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
DCLRE1CQ96SD1 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
DCLRE1CQ96SD1 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
DCLRE1CQ96SD1 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
DCLRE1CQ96SD1 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
DCLRE1CQ96SD1 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
DCLRE1CQ96SD1 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
DCLRE1CQ96SD1 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
DCLRE1CQ96SD1 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
DCLRE1CQ96SD1 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
DCLRE1CQ96SD1 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
DCLRE1CQ96SD1 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
DCLRE1CQ96SD1 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
DCLRE1CQ96SD1 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
DCLRE1CQ96SD1 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
DCLRE1CQ96SD1 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
DCLRE1CQ96SD1 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
DCLRE1CQ96SD1 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
DCLRE1CQ96SD1 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.4 ms