Protein–RNA interactions for Protein: Q96LD4

TRIM47, Tripartite motif-containing protein 47, humanhuman

Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM47Q96LD4 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRIM47Q96LD4 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRIM47Q96LD4 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRIM47Q96LD4 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRIM47Q96LD4 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRIM47Q96LD4 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRIM47Q96LD4 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRIM47Q96LD4 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRIM47Q96LD4 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRIM47Q96LD4 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRIM47Q96LD4 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRIM47Q96LD4 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRIM47Q96LD4 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRIM47Q96LD4 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRIM47Q96LD4 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRIM47Q96LD4 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRIM47Q96LD4 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRIM47Q96LD4 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRIM47Q96LD4 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRIM47Q96LD4 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRIM47Q96LD4 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRIM47Q96LD4 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRIM47Q96LD4 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
TRIM47Q96LD4 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRIM47Q96LD4 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
TRIM47Q96LD4 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRIM47Q96LD4 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
TRIM47Q96LD4 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRIM47Q96LD4 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRIM47Q96LD4 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRIM47Q96LD4 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
TRIM47Q96LD4 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRIM47Q96LD4 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRIM47Q96LD4 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRIM47Q96LD4 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRIM47Q96LD4 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRIM47Q96LD4 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRIM47Q96LD4 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRIM47Q96LD4 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRIM47Q96LD4 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRIM47Q96LD4 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRIM47Q96LD4 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TRIM47Q96LD4 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TRIM47Q96LD4 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TRIM47Q96LD4 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TRIM47Q96LD4 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TRIM47Q96LD4 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TRIM47Q96LD4 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TRIM47Q96LD4 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TRIM47Q96LD4 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TRIM47Q96LD4 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TRIM47Q96LD4 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
TRIM47Q96LD4 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
TRIM47Q96LD4 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TRIM47Q96LD4 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TRIM47Q96LD4 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TRIM47Q96LD4 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
TRIM47Q96LD4 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TRIM47Q96LD4 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TRIM47Q96LD4 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TRIM47Q96LD4 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
TRIM47Q96LD4 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
TRIM47Q96LD4 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
TRIM47Q96LD4 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
TRIM47Q96LD4 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TRIM47Q96LD4 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TRIM47Q96LD4 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TRIM47Q96LD4 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
TRIM47Q96LD4 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
TRIM47Q96LD4 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
TRIM47Q96LD4 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TRIM47Q96LD4 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TRIM47Q96LD4 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TRIM47Q96LD4 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC21.32■■□□□ 1
TRIM47Q96LD4 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC21.32■■□□□ 1
TRIM47Q96LD4 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TRIM47Q96LD4 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TRIM47Q96LD4 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TRIM47Q96LD4 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TRIM47Q96LD4 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TRIM47Q96LD4 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
TRIM47Q96LD4 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC21.32■■□□□ 1
TRIM47Q96LD4 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC21.32■■□□□ 1
TRIM47Q96LD4 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
TRIM47Q96LD4 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
TRIM47Q96LD4 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
TRIM47Q96LD4 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
TRIM47Q96LD4 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TRIM47Q96LD4 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC21.32■■□□□ 1
TRIM47Q96LD4 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
TRIM47Q96LD4 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TRIM47Q96LD4 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TRIM47Q96LD4 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TRIM47Q96LD4 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC21.31■■□□□ 1
TRIM47Q96LD4 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TRIM47Q96LD4 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
TRIM47Q96LD4 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
TRIM47Q96LD4 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
TRIM47Q96LD4 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TRIM47Q96LD4 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms