Protein–RNA interactions for Protein: Q96JQ0

DCHS1, Protocadherin-16, humanhuman

Predictions only

Length 3,298 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCHS1Q96JQ0 AGTRAP-202ENST00000376627 1055 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
DCHS1Q96JQ0 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
DCHS1Q96JQ0 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
DCHS1Q96JQ0 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
DCHS1Q96JQ0 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
DCHS1Q96JQ0 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
DCHS1Q96JQ0 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
DCHS1Q96JQ0 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
DCHS1Q96JQ0 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
DCHS1Q96JQ0 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
DCHS1Q96JQ0 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
DCHS1Q96JQ0 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
DCHS1Q96JQ0 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
DCHS1Q96JQ0 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
DCHS1Q96JQ0 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
DCHS1Q96JQ0 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
DCHS1Q96JQ0 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
DCHS1Q96JQ0 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
DCHS1Q96JQ0 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
DCHS1Q96JQ0 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
DCHS1Q96JQ0 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
DCHS1Q96JQ0 NAA10-201ENST00000370009 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
DCHS1Q96JQ0 NAA10-203ENST00000370015 1002 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
DCHS1Q96JQ0 RPS2P32-201ENST00000439199 892 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
DCHS1Q96JQ0 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
DCHS1Q96JQ0 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
DCHS1Q96JQ0 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
DCHS1Q96JQ0 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
DCHS1Q96JQ0 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
DCHS1Q96JQ0 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
DCHS1Q96JQ0 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
DCHS1Q96JQ0 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
DCHS1Q96JQ0 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
DCHS1Q96JQ0 ATP6V0B-201ENST00000236067 944 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
DCHS1Q96JQ0 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
DCHS1Q96JQ0 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
DCHS1Q96JQ0 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
DCHS1Q96JQ0 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
DCHS1Q96JQ0 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
DCHS1Q96JQ0 ATP6V0B-211ENST00000498664 825 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
DCHS1Q96JQ0 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
DCHS1Q96JQ0 HILS1-202ENST00000545329 423 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
DCHS1Q96JQ0 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
DCHS1Q96JQ0 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
DCHS1Q96JQ0 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
DCHS1Q96JQ0 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
DCHS1Q96JQ0 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
DCHS1Q96JQ0 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
DCHS1Q96JQ0 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
DCHS1Q96JQ0 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
DCHS1Q96JQ0 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
DCHS1Q96JQ0 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
DCHS1Q96JQ0 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
DCHS1Q96JQ0 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
DCHS1Q96JQ0 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
DCHS1Q96JQ0 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
DCHS1Q96JQ0 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
DCHS1Q96JQ0 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
DCHS1Q96JQ0 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
DCHS1Q96JQ0 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
DCHS1Q96JQ0 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
DCHS1Q96JQ0 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
DCHS1Q96JQ0 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
DCHS1Q96JQ0 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
DCHS1Q96JQ0 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
DCHS1Q96JQ0 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
DCHS1Q96JQ0 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
DCHS1Q96JQ0 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
DCHS1Q96JQ0 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
DCHS1Q96JQ0 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
DCHS1Q96JQ0 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
DCHS1Q96JQ0 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
DCHS1Q96JQ0 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
DCHS1Q96JQ0 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
DCHS1Q96JQ0 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
DCHS1Q96JQ0 ASF1B-202ENST00000474890 765 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
DCHS1Q96JQ0 MRPL52-211ENST00000555536 451 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
DCHS1Q96JQ0 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
DCHS1Q96JQ0 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
DCHS1Q96JQ0 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
DCHS1Q96JQ0 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
DCHS1Q96JQ0 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
DCHS1Q96JQ0 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
DCHS1Q96JQ0 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
DCHS1Q96JQ0 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
DCHS1Q96JQ0 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
DCHS1Q96JQ0 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
DCHS1Q96JQ0 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
DCHS1Q96JQ0 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
DCHS1Q96JQ0 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
DCHS1Q96JQ0 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
DCHS1Q96JQ0 AL033527.4-201ENST00000641026 673 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
DCHS1Q96JQ0 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
DCHS1Q96JQ0 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
DCHS1Q96JQ0 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
DCHS1Q96JQ0 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
DCHS1Q96JQ0 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
DCHS1Q96JQ0 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
DCHS1Q96JQ0 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
DCHS1Q96JQ0 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.7 ms