Protein–RNA interactions for Protein: Q96JA1

LRIG1, Leucine-rich repeats and immunoglobulin-like domains protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,093 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRIG1Q96JA1 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LRIG1Q96JA1 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
LRIG1Q96JA1 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
LRIG1Q96JA1 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LRIG1Q96JA1 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
LRIG1Q96JA1 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LRIG1Q96JA1 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
LRIG1Q96JA1 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
LRIG1Q96JA1 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LRIG1Q96JA1 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
LRIG1Q96JA1 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LRIG1Q96JA1 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LRIG1Q96JA1 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LRIG1Q96JA1 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
LRIG1Q96JA1 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LRIG1Q96JA1 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LRIG1Q96JA1 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LRIG1Q96JA1 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
LRIG1Q96JA1 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LRIG1Q96JA1 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
LRIG1Q96JA1 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LRIG1Q96JA1 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LRIG1Q96JA1 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
LRIG1Q96JA1 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LRIG1Q96JA1 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LRIG1Q96JA1 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LRIG1Q96JA1 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LRIG1Q96JA1 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
LRIG1Q96JA1 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LRIG1Q96JA1 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LRIG1Q96JA1 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
LRIG1Q96JA1 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
LRIG1Q96JA1 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
LRIG1Q96JA1 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
LRIG1Q96JA1 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
LRIG1Q96JA1 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
LRIG1Q96JA1 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
LRIG1Q96JA1 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LRIG1Q96JA1 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
LRIG1Q96JA1 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
LRIG1Q96JA1 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
LRIG1Q96JA1 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
LRIG1Q96JA1 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LRIG1Q96JA1 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
LRIG1Q96JA1 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LRIG1Q96JA1 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LRIG1Q96JA1 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
LRIG1Q96JA1 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
LRIG1Q96JA1 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LRIG1Q96JA1 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
LRIG1Q96JA1 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
LRIG1Q96JA1 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
LRIG1Q96JA1 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
LRIG1Q96JA1 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
LRIG1Q96JA1 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
LRIG1Q96JA1 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
LRIG1Q96JA1 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
LRIG1Q96JA1 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
LRIG1Q96JA1 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
LRIG1Q96JA1 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
LRIG1Q96JA1 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
LRIG1Q96JA1 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
LRIG1Q96JA1 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
LRIG1Q96JA1 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
LRIG1Q96JA1 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
LRIG1Q96JA1 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.52
LRIG1Q96JA1 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
LRIG1Q96JA1 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
LRIG1Q96JA1 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
LRIG1Q96JA1 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
LRIG1Q96JA1 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
LRIG1Q96JA1 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
LRIG1Q96JA1 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
LRIG1Q96JA1 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
LRIG1Q96JA1 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
LRIG1Q96JA1 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
LRIG1Q96JA1 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
LRIG1Q96JA1 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
LRIG1Q96JA1 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
LRIG1Q96JA1 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
LRIG1Q96JA1 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
LRIG1Q96JA1 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LRIG1Q96JA1 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
LRIG1Q96JA1 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
LRIG1Q96JA1 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
LRIG1Q96JA1 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LRIG1Q96JA1 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
LRIG1Q96JA1 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LRIG1Q96JA1 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LRIG1Q96JA1 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LRIG1Q96JA1 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
LRIG1Q96JA1 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
LRIG1Q96JA1 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LRIG1Q96JA1 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
LRIG1Q96JA1 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LRIG1Q96JA1 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LRIG1Q96JA1 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LRIG1Q96JA1 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
LRIG1Q96JA1 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
LRIG1Q96JA1 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 99.7 ms