Protein–RNA interactions for Protein: Q96J77

TPD52L3, Tumor protein D55, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPD52L3Q96J77 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
TPD52L3Q96J77 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TPD52L3Q96J77 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TPD52L3Q96J77 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TPD52L3Q96J77 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TPD52L3Q96J77 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TPD52L3Q96J77 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TPD52L3Q96J77 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TPD52L3Q96J77 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TPD52L3Q96J77 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TPD52L3Q96J77 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TPD52L3Q96J77 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TPD52L3Q96J77 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TPD52L3Q96J77 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TPD52L3Q96J77 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TPD52L3Q96J77 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TPD52L3Q96J77 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TPD52L3Q96J77 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TPD52L3Q96J77 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TPD52L3Q96J77 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TPD52L3Q96J77 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
TPD52L3Q96J77 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
TPD52L3Q96J77 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TPD52L3Q96J77 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TPD52L3Q96J77 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TPD52L3Q96J77 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TPD52L3Q96J77 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TPD52L3Q96J77 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TPD52L3Q96J77 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TPD52L3Q96J77 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TPD52L3Q96J77 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TPD52L3Q96J77 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TPD52L3Q96J77 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TPD52L3Q96J77 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TPD52L3Q96J77 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TPD52L3Q96J77 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TPD52L3Q96J77 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TPD52L3Q96J77 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TPD52L3Q96J77 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TPD52L3Q96J77 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
TPD52L3Q96J77 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TPD52L3Q96J77 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
TPD52L3Q96J77 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TPD52L3Q96J77 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TPD52L3Q96J77 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TPD52L3Q96J77 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TPD52L3Q96J77 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TPD52L3Q96J77 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
TPD52L3Q96J77 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TPD52L3Q96J77 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TPD52L3Q96J77 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TPD52L3Q96J77 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TPD52L3Q96J77 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TPD52L3Q96J77 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TPD52L3Q96J77 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TPD52L3Q96J77 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TPD52L3Q96J77 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TPD52L3Q96J77 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TPD52L3Q96J77 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TPD52L3Q96J77 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TPD52L3Q96J77 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TPD52L3Q96J77 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TPD52L3Q96J77 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TPD52L3Q96J77 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
TPD52L3Q96J77 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TPD52L3Q96J77 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TPD52L3Q96J77 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TPD52L3Q96J77 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TPD52L3Q96J77 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TPD52L3Q96J77 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TPD52L3Q96J77 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TPD52L3Q96J77 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
TPD52L3Q96J77 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TPD52L3Q96J77 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TPD52L3Q96J77 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TPD52L3Q96J77 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TPD52L3Q96J77 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TPD52L3Q96J77 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TPD52L3Q96J77 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
TPD52L3Q96J77 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TPD52L3Q96J77 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TPD52L3Q96J77 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TPD52L3Q96J77 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TPD52L3Q96J77 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TPD52L3Q96J77 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TPD52L3Q96J77 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TPD52L3Q96J77 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TPD52L3Q96J77 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TPD52L3Q96J77 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TPD52L3Q96J77 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TPD52L3Q96J77 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TPD52L3Q96J77 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TPD52L3Q96J77 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TPD52L3Q96J77 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TPD52L3Q96J77 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
TPD52L3Q96J77 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TPD52L3Q96J77 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TPD52L3Q96J77 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
TPD52L3Q96J77 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
TPD52L3Q96J77 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.6 ms