Protein–RNA interactions for Protein: Q86WV1

SKAP1, Src kinase-associated phosphoprotein 1, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKAP1Q86WV1 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SKAP1Q86WV1 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SKAP1Q86WV1 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SKAP1Q86WV1 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SKAP1Q86WV1 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SKAP1Q86WV1 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SKAP1Q86WV1 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
SKAP1Q86WV1 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
SKAP1Q86WV1 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SKAP1Q86WV1 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SKAP1Q86WV1 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SKAP1Q86WV1 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
SKAP1Q86WV1 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SKAP1Q86WV1 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SKAP1Q86WV1 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SKAP1Q86WV1 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SKAP1Q86WV1 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SKAP1Q86WV1 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SKAP1Q86WV1 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SKAP1Q86WV1 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SKAP1Q86WV1 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SKAP1Q86WV1 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SKAP1Q86WV1 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SKAP1Q86WV1 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SKAP1Q86WV1 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SKAP1Q86WV1 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SKAP1Q86WV1 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SKAP1Q86WV1 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SKAP1Q86WV1 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SKAP1Q86WV1 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SKAP1Q86WV1 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SKAP1Q86WV1 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SKAP1Q86WV1 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
SKAP1Q86WV1 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SKAP1Q86WV1 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SKAP1Q86WV1 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
SKAP1Q86WV1 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
SKAP1Q86WV1 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
SKAP1Q86WV1 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
SKAP1Q86WV1 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SKAP1Q86WV1 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SKAP1Q86WV1 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SKAP1Q86WV1 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SKAP1Q86WV1 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SKAP1Q86WV1 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SKAP1Q86WV1 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SKAP1Q86WV1 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SKAP1Q86WV1 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SKAP1Q86WV1 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SKAP1Q86WV1 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SKAP1Q86WV1 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SKAP1Q86WV1 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
SKAP1Q86WV1 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SKAP1Q86WV1 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SKAP1Q86WV1 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SKAP1Q86WV1 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SKAP1Q86WV1 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SKAP1Q86WV1 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SKAP1Q86WV1 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SKAP1Q86WV1 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SKAP1Q86WV1 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SKAP1Q86WV1 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SKAP1Q86WV1 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SKAP1Q86WV1 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SKAP1Q86WV1 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SKAP1Q86WV1 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
SKAP1Q86WV1 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SKAP1Q86WV1 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SKAP1Q86WV1 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SKAP1Q86WV1 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
SKAP1Q86WV1 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SKAP1Q86WV1 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SKAP1Q86WV1 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SKAP1Q86WV1 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SKAP1Q86WV1 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SKAP1Q86WV1 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
SKAP1Q86WV1 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
SKAP1Q86WV1 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SKAP1Q86WV1 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SKAP1Q86WV1 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SKAP1Q86WV1 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SKAP1Q86WV1 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
SKAP1Q86WV1 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SKAP1Q86WV1 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SKAP1Q86WV1 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SKAP1Q86WV1 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SKAP1Q86WV1 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SKAP1Q86WV1 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SKAP1Q86WV1 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SKAP1Q86WV1 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SKAP1Q86WV1 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SKAP1Q86WV1 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SKAP1Q86WV1 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SKAP1Q86WV1 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SKAP1Q86WV1 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SKAP1Q86WV1 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SKAP1Q86WV1 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SKAP1Q86WV1 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SKAP1Q86WV1 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SKAP1Q86WV1 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms