Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTU9

STRC, Stereocilin, humanhuman

Predictions only

Length 1,775 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRCQ7RTU9 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC25.69■■□□□ 1.7
STRCQ7RTU9 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
STRCQ7RTU9 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
STRCQ7RTU9 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
STRCQ7RTU9 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
STRCQ7RTU9 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
STRCQ7RTU9 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
STRCQ7RTU9 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
STRCQ7RTU9 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
STRCQ7RTU9 HEBP2-202ENST00000448741 661 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
STRCQ7RTU9 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
STRCQ7RTU9 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
STRCQ7RTU9 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
STRCQ7RTU9 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
STRCQ7RTU9 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
STRCQ7RTU9 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
STRCQ7RTU9 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
STRCQ7RTU9 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
STRCQ7RTU9 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
STRCQ7RTU9 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
STRCQ7RTU9 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
STRCQ7RTU9 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
STRCQ7RTU9 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
STRCQ7RTU9 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
STRCQ7RTU9 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
STRCQ7RTU9 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
STRCQ7RTU9 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
STRCQ7RTU9 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
STRCQ7RTU9 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
STRCQ7RTU9 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
STRCQ7RTU9 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
STRCQ7RTU9 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
STRCQ7RTU9 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
STRCQ7RTU9 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
STRCQ7RTU9 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
STRCQ7RTU9 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
STRCQ7RTU9 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
STRCQ7RTU9 IGHV3-7-201ENST00000390598 430 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
STRCQ7RTU9 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
STRCQ7RTU9 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
STRCQ7RTU9 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
STRCQ7RTU9 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
STRCQ7RTU9 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
STRCQ7RTU9 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
STRCQ7RTU9 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
STRCQ7RTU9 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
STRCQ7RTU9 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
STRCQ7RTU9 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
STRCQ7RTU9 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
STRCQ7RTU9 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
STRCQ7RTU9 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
STRCQ7RTU9 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
STRCQ7RTU9 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
STRCQ7RTU9 MACROD2-AS1-201ENST00000439451 1230 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
STRCQ7RTU9 GNG2-209ENST00000555472 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
STRCQ7RTU9 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
STRCQ7RTU9 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
STRCQ7RTU9 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
STRCQ7RTU9 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
STRCQ7RTU9 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
STRCQ7RTU9 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
STRCQ7RTU9 UBE2E3-205ENST00000602475 602 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
STRCQ7RTU9 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
STRCQ7RTU9 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
STRCQ7RTU9 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
STRCQ7RTU9 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
STRCQ7RTU9 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
STRCQ7RTU9 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
STRCQ7RTU9 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
STRCQ7RTU9 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
STRCQ7RTU9 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
STRCQ7RTU9 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
STRCQ7RTU9 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
STRCQ7RTU9 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
STRCQ7RTU9 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
STRCQ7RTU9 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
STRCQ7RTU9 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
STRCQ7RTU9 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
STRCQ7RTU9 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
STRCQ7RTU9 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
STRCQ7RTU9 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
STRCQ7RTU9 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
STRCQ7RTU9 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
STRCQ7RTU9 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
STRCQ7RTU9 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC25.64■■□□□ 1.69
STRCQ7RTU9 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.69
STRCQ7RTU9 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.69
STRCQ7RTU9 ACAP1-208ENST00000574499 412 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
STRCQ7RTU9 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
STRCQ7RTU9 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC25.64■■□□□ 1.69
STRCQ7RTU9 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
STRCQ7RTU9 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
STRCQ7RTU9 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
STRCQ7RTU9 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
STRCQ7RTU9 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
STRCQ7RTU9 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
STRCQ7RTU9 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
STRCQ7RTU9 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
STRCQ7RTU9 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
STRCQ7RTU9 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms