Protein–RNA interactions for Protein: Q70EL4

USP43, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 43, humanhuman

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Length 1,123 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP43Q70EL4 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
USP43Q70EL4 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
USP43Q70EL4 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
USP43Q70EL4 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
USP43Q70EL4 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
USP43Q70EL4 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
USP43Q70EL4 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.66■□□□□ 0.26
USP43Q70EL4 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
USP43Q70EL4 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
USP43Q70EL4 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
USP43Q70EL4 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
USP43Q70EL4 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
USP43Q70EL4 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
USP43Q70EL4 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
USP43Q70EL4 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
USP43Q70EL4 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
USP43Q70EL4 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
USP43Q70EL4 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
USP43Q70EL4 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
USP43Q70EL4 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
USP43Q70EL4 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
USP43Q70EL4 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
USP43Q70EL4 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
USP43Q70EL4 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
USP43Q70EL4 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
USP43Q70EL4 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
USP43Q70EL4 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
USP43Q70EL4 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
USP43Q70EL4 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
USP43Q70EL4 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
USP43Q70EL4 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
USP43Q70EL4 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
USP43Q70EL4 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
USP43Q70EL4 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
USP43Q70EL4 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
USP43Q70EL4 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
USP43Q70EL4 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
USP43Q70EL4 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
USP43Q70EL4 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
USP43Q70EL4 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
USP43Q70EL4 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
USP43Q70EL4 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
USP43Q70EL4 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
USP43Q70EL4 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
USP43Q70EL4 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
USP43Q70EL4 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
USP43Q70EL4 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
USP43Q70EL4 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
USP43Q70EL4 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
USP43Q70EL4 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
USP43Q70EL4 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
USP43Q70EL4 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
USP43Q70EL4 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
USP43Q70EL4 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
USP43Q70EL4 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
USP43Q70EL4 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
USP43Q70EL4 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
USP43Q70EL4 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
USP43Q70EL4 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
USP43Q70EL4 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
USP43Q70EL4 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
USP43Q70EL4 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
USP43Q70EL4 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
USP43Q70EL4 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
USP43Q70EL4 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
USP43Q70EL4 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
USP43Q70EL4 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
USP43Q70EL4 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
USP43Q70EL4 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
USP43Q70EL4 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
USP43Q70EL4 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
USP43Q70EL4 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
USP43Q70EL4 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
USP43Q70EL4 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
USP43Q70EL4 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
USP43Q70EL4 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
USP43Q70EL4 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
USP43Q70EL4 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
USP43Q70EL4 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
USP43Q70EL4 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
USP43Q70EL4 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
USP43Q70EL4 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
USP43Q70EL4 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
USP43Q70EL4 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
USP43Q70EL4 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
USP43Q70EL4 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
USP43Q70EL4 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
USP43Q70EL4 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
USP43Q70EL4 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC16.64■□□□□ 0.25
USP43Q70EL4 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
USP43Q70EL4 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
USP43Q70EL4 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC16.64■□□□□ 0.25
USP43Q70EL4 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
USP43Q70EL4 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
USP43Q70EL4 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
USP43Q70EL4 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
USP43Q70EL4 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
USP43Q70EL4 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
USP43Q70EL4 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
USP43Q70EL4 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
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