Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZRR7

LRRC9, Leucine-rich repeat-containing protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,453 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC9Q6ZRR7 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
LRRC9Q6ZRR7 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
LRRC9Q6ZRR7 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
LRRC9Q6ZRR7 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
LRRC9Q6ZRR7 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
LRRC9Q6ZRR7 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
LRRC9Q6ZRR7 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
LRRC9Q6ZRR7 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
LRRC9Q6ZRR7 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
LRRC9Q6ZRR7 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
LRRC9Q6ZRR7 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
LRRC9Q6ZRR7 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
LRRC9Q6ZRR7 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
LRRC9Q6ZRR7 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
LRRC9Q6ZRR7 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
LRRC9Q6ZRR7 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
LRRC9Q6ZRR7 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
LRRC9Q6ZRR7 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
LRRC9Q6ZRR7 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
LRRC9Q6ZRR7 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
LRRC9Q6ZRR7 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
LRRC9Q6ZRR7 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
LRRC9Q6ZRR7 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
LRRC9Q6ZRR7 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
LRRC9Q6ZRR7 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
LRRC9Q6ZRR7 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
LRRC9Q6ZRR7 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
LRRC9Q6ZRR7 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
LRRC9Q6ZRR7 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
LRRC9Q6ZRR7 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
LRRC9Q6ZRR7 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
LRRC9Q6ZRR7 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
LRRC9Q6ZRR7 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
LRRC9Q6ZRR7 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
LRRC9Q6ZRR7 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
LRRC9Q6ZRR7 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
LRRC9Q6ZRR7 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC27.92■■■□□ 2.06
LRRC9Q6ZRR7 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
LRRC9Q6ZRR7 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
LRRC9Q6ZRR7 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
LRRC9Q6ZRR7 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
LRRC9Q6ZRR7 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
LRRC9Q6ZRR7 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
LRRC9Q6ZRR7 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
LRRC9Q6ZRR7 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
LRRC9Q6ZRR7 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
LRRC9Q6ZRR7 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
LRRC9Q6ZRR7 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
LRRC9Q6ZRR7 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
LRRC9Q6ZRR7 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
LRRC9Q6ZRR7 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC27.91■■■□□ 2.06
LRRC9Q6ZRR7 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
LRRC9Q6ZRR7 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
LRRC9Q6ZRR7 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC27.91■■■□□ 2.06
LRRC9Q6ZRR7 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
LRRC9Q6ZRR7 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
LRRC9Q6ZRR7 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
LRRC9Q6ZRR7 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
LRRC9Q6ZRR7 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
LRRC9Q6ZRR7 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
LRRC9Q6ZRR7 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
LRRC9Q6ZRR7 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
LRRC9Q6ZRR7 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
LRRC9Q6ZRR7 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
LRRC9Q6ZRR7 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
LRRC9Q6ZRR7 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
LRRC9Q6ZRR7 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
LRRC9Q6ZRR7 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
LRRC9Q6ZRR7 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
LRRC9Q6ZRR7 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
LRRC9Q6ZRR7 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
LRRC9Q6ZRR7 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
LRRC9Q6ZRR7 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
LRRC9Q6ZRR7 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
LRRC9Q6ZRR7 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
LRRC9Q6ZRR7 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
LRRC9Q6ZRR7 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
LRRC9Q6ZRR7 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
LRRC9Q6ZRR7 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
LRRC9Q6ZRR7 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
LRRC9Q6ZRR7 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
LRRC9Q6ZRR7 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
LRRC9Q6ZRR7 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
LRRC9Q6ZRR7 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
LRRC9Q6ZRR7 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
LRRC9Q6ZRR7 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
LRRC9Q6ZRR7 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
LRRC9Q6ZRR7 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
LRRC9Q6ZRR7 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
LRRC9Q6ZRR7 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
LRRC9Q6ZRR7 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
LRRC9Q6ZRR7 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
LRRC9Q6ZRR7 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
LRRC9Q6ZRR7 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
LRRC9Q6ZRR7 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
LRRC9Q6ZRR7 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
LRRC9Q6ZRR7 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
LRRC9Q6ZRR7 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
LRRC9Q6ZRR7 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
LRRC9Q6ZRR7 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms