Protein–RNA interactions for Protein: Q6NT89

TRNP1, TMF-regulated nuclear protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRNP1Q6NT89 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TRNP1Q6NT89 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TRNP1Q6NT89 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
TRNP1Q6NT89 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TRNP1Q6NT89 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TRNP1Q6NT89 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TRNP1Q6NT89 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TRNP1Q6NT89 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
TRNP1Q6NT89 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TRNP1Q6NT89 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TRNP1Q6NT89 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TRNP1Q6NT89 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TRNP1Q6NT89 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TRNP1Q6NT89 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TRNP1Q6NT89 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TRNP1Q6NT89 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TRNP1Q6NT89 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TRNP1Q6NT89 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
TRNP1Q6NT89 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
TRNP1Q6NT89 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
TRNP1Q6NT89 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
TRNP1Q6NT89 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
TRNP1Q6NT89 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
TRNP1Q6NT89 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
TRNP1Q6NT89 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
TRNP1Q6NT89 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
TRNP1Q6NT89 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
TRNP1Q6NT89 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TRNP1Q6NT89 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TRNP1Q6NT89 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TRNP1Q6NT89 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TRNP1Q6NT89 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TRNP1Q6NT89 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TRNP1Q6NT89 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TRNP1Q6NT89 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TRNP1Q6NT89 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TRNP1Q6NT89 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TRNP1Q6NT89 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TRNP1Q6NT89 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TRNP1Q6NT89 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TRNP1Q6NT89 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TRNP1Q6NT89 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TRNP1Q6NT89 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TRNP1Q6NT89 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TRNP1Q6NT89 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TRNP1Q6NT89 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TRNP1Q6NT89 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TRNP1Q6NT89 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
TRNP1Q6NT89 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TRNP1Q6NT89 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
TRNP1Q6NT89 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TRNP1Q6NT89 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TRNP1Q6NT89 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TRNP1Q6NT89 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TRNP1Q6NT89 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC19■□□□□ 0.63
TRNP1Q6NT89 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TRNP1Q6NT89 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TRNP1Q6NT89 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
TRNP1Q6NT89 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TRNP1Q6NT89 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
TRNP1Q6NT89 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TRNP1Q6NT89 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
TRNP1Q6NT89 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TRNP1Q6NT89 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC19■□□□□ 0.63
TRNP1Q6NT89 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TRNP1Q6NT89 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
TRNP1Q6NT89 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
TRNP1Q6NT89 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
TRNP1Q6NT89 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19■□□□□ 0.63
TRNP1Q6NT89 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC19■□□□□ 0.63
TRNP1Q6NT89 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
TRNP1Q6NT89 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
TRNP1Q6NT89 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TRNP1Q6NT89 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TRNP1Q6NT89 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TRNP1Q6NT89 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
TRNP1Q6NT89 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TRNP1Q6NT89 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
TRNP1Q6NT89 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TRNP1Q6NT89 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
TRNP1Q6NT89 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
TRNP1Q6NT89 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TRNP1Q6NT89 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
TRNP1Q6NT89 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
TRNP1Q6NT89 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TRNP1Q6NT89 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TRNP1Q6NT89 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TRNP1Q6NT89 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TRNP1Q6NT89 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TRNP1Q6NT89 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TRNP1Q6NT89 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TRNP1Q6NT89 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TRNP1Q6NT89 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TRNP1Q6NT89 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TRNP1Q6NT89 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TRNP1Q6NT89 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
TRNP1Q6NT89 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TRNP1Q6NT89 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
TRNP1Q6NT89 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TRNP1Q6NT89 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms