Protein–RNA interactions for Protein: Q3SY46

KRTAP13-3, Keratin-associated protein 13-3, humanhuman

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Length 172 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP13-3Q3SY46 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
KRTAP13-3Q3SY46 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
KRTAP13-3Q3SY46 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.37□□□□□ -0.75
KRTAP13-3Q3SY46 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
KRTAP13-3Q3SY46 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC10.37□□□□□ -0.75
KRTAP13-3Q3SY46 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
KRTAP13-3Q3SY46 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC10.37□□□□□ -0.75
KRTAP13-3Q3SY46 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
KRTAP13-3Q3SY46 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
KRTAP13-3Q3SY46 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
KRTAP13-3Q3SY46 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
KRTAP13-3Q3SY46 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
KRTAP13-3Q3SY46 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
KRTAP13-3Q3SY46 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
KRTAP13-3Q3SY46 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
KRTAP13-3Q3SY46 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
KRTAP13-3Q3SY46 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
KRTAP13-3Q3SY46 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
KRTAP13-3Q3SY46 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
KRTAP13-3Q3SY46 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
KRTAP13-3Q3SY46 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
KRTAP13-3Q3SY46 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
KRTAP13-3Q3SY46 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
KRTAP13-3Q3SY46 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
KRTAP13-3Q3SY46 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
KRTAP13-3Q3SY46 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
KRTAP13-3Q3SY46 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
KRTAP13-3Q3SY46 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
KRTAP13-3Q3SY46 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
KRTAP13-3Q3SY46 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
KRTAP13-3Q3SY46 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
KRTAP13-3Q3SY46 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
KRTAP13-3Q3SY46 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
KRTAP13-3Q3SY46 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
KRTAP13-3Q3SY46 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
KRTAP13-3Q3SY46 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC10.36□□□□□ -0.75
KRTAP13-3Q3SY46 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
KRTAP13-3Q3SY46 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
KRTAP13-3Q3SY46 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
KRTAP13-3Q3SY46 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
KRTAP13-3Q3SY46 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC10.36□□□□□ -0.75
KRTAP13-3Q3SY46 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
KRTAP13-3Q3SY46 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
KRTAP13-3Q3SY46 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
KRTAP13-3Q3SY46 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
KRTAP13-3Q3SY46 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
KRTAP13-3Q3SY46 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
KRTAP13-3Q3SY46 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
KRTAP13-3Q3SY46 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
KRTAP13-3Q3SY46 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
KRTAP13-3Q3SY46 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
KRTAP13-3Q3SY46 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
KRTAP13-3Q3SY46 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
KRTAP13-3Q3SY46 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
KRTAP13-3Q3SY46 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
KRTAP13-3Q3SY46 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
KRTAP13-3Q3SY46 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
KRTAP13-3Q3SY46 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
KRTAP13-3Q3SY46 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
KRTAP13-3Q3SY46 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
KRTAP13-3Q3SY46 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC10.36□□□□□ -0.75
KRTAP13-3Q3SY46 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
KRTAP13-3Q3SY46 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
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KRTAP13-3Q3SY46 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
KRTAP13-3Q3SY46 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
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KRTAP13-3Q3SY46 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
KRTAP13-3Q3SY46 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
KRTAP13-3Q3SY46 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
KRTAP13-3Q3SY46 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
KRTAP13-3Q3SY46 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
KRTAP13-3Q3SY46 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
KRTAP13-3Q3SY46 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
KRTAP13-3Q3SY46 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
KRTAP13-3Q3SY46 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
KRTAP13-3Q3SY46 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
KRTAP13-3Q3SY46 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
KRTAP13-3Q3SY46 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
KRTAP13-3Q3SY46 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
KRTAP13-3Q3SY46 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
KRTAP13-3Q3SY46 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
KRTAP13-3Q3SY46 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
KRTAP13-3Q3SY46 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
KRTAP13-3Q3SY46 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
KRTAP13-3Q3SY46 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
KRTAP13-3Q3SY46 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
KRTAP13-3Q3SY46 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
KRTAP13-3Q3SY46 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
KRTAP13-3Q3SY46 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
KRTAP13-3Q3SY46 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
KRTAP13-3Q3SY46 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
KRTAP13-3Q3SY46 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
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